Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kpna7C0LLJ0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna7C0LLJ0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna7C0LLJ0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms