Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm438B1ASB3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm438B1ASB3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm438B1ASB3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm438B1ASB3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm438B1ASB3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gm438B1ASB3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm438B1ASB3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm438B1ASB3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm438B1ASB3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm438B1ASB3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms