Protein–RNA interactions for Protein: A3KGK3

Fer1l4, Fer-1-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fer1l4A3KGK3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fer1l4A3KGK3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fer1l4A3KGK3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fer1l4A3KGK3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fer1l4A3KGK3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fer1l4A3KGK3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fer1l4A3KGK3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fer1l4A3KGK3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fer1l4A3KGK3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fer1l4A3KGK3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fer1l4A3KGK3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fer1l4A3KGK3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fer1l4A3KGK3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fer1l4A3KGK3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fer1l4A3KGK3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fer1l4A3KGK3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fer1l4A3KGK3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fer1l4A3KGK3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fer1l4A3KGK3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fer1l4A3KGK3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fer1l4A3KGK3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fer1l4A3KGK3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fer1l4A3KGK3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fer1l4A3KGK3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fer1l4A3KGK3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fer1l4A3KGK3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fer1l4A3KGK3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fer1l4A3KGK3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fer1l4A3KGK3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fer1l4A3KGK3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fer1l4A3KGK3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fer1l4A3KGK3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fer1l4A3KGK3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fer1l4A3KGK3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fer1l4A3KGK3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fer1l4A3KGK3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fer1l4A3KGK3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fer1l4A3KGK3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fer1l4A3KGK3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fer1l4A3KGK3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fer1l4A3KGK3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fer1l4A3KGK3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fer1l4A3KGK3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fer1l4A3KGK3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fer1l4A3KGK3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fer1l4A3KGK3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fer1l4A3KGK3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fer1l4A3KGK3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fer1l4A3KGK3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fer1l4A3KGK3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fer1l4A3KGK3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fer1l4A3KGK3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fer1l4A3KGK3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fer1l4A3KGK3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fer1l4A3KGK3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fer1l4A3KGK3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fer1l4A3KGK3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fer1l4A3KGK3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fer1l4A3KGK3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fer1l4A3KGK3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fer1l4A3KGK3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fer1l4A3KGK3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fer1l4A3KGK3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fer1l4A3KGK3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fer1l4A3KGK3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fer1l4A3KGK3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fer1l4A3KGK3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fer1l4A3KGK3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fer1l4A3KGK3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fer1l4A3KGK3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fer1l4A3KGK3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fer1l4A3KGK3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fer1l4A3KGK3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fer1l4A3KGK3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fer1l4A3KGK3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fer1l4A3KGK3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fer1l4A3KGK3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fer1l4A3KGK3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms