Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Upf2A2AT37 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Upf2A2AT37 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Upf2A2AT37 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Upf2A2AT37 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Upf2A2AT37 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Upf2A2AT37 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Upf2A2AT37 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Upf2A2AT37 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Upf2A2AT37 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Upf2A2AT37 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Upf2A2AT37 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Upf2A2AT37 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Upf2A2AT37 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Upf2A2AT37 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Upf2A2AT37 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Upf2A2AT37 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Upf2A2AT37 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Upf2A2AT37 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Upf2A2AT37 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Upf2A2AT37 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Upf2A2AT37 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Upf2A2AT37 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Upf2A2AT37 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Upf2A2AT37 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Upf2A2AT37 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Upf2A2AT37 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Upf2A2AT37 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Upf2A2AT37 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Upf2A2AT37 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Upf2A2AT37 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Upf2A2AT37 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Upf2A2AT37 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Upf2A2AT37 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Upf2A2AT37 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Upf2A2AT37 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Upf2A2AT37 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Upf2A2AT37 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Upf2A2AT37 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Upf2A2AT37 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Upf2A2AT37 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Upf2A2AT37 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Upf2A2AT37 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Upf2A2AT37 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Upf2A2AT37 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Upf2A2AT37 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Upf2A2AT37 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Upf2A2AT37 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Upf2A2AT37 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Upf2A2AT37 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Upf2A2AT37 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Upf2A2AT37 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Upf2A2AT37 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Upf2A2AT37 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Upf2A2AT37 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Upf2A2AT37 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Upf2A2AT37 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Upf2A2AT37 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Upf2A2AT37 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Upf2A2AT37 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Upf2A2AT37 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Upf2A2AT37 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Upf2A2AT37 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Upf2A2AT37 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Upf2A2AT37 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Upf2A2AT37 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Upf2A2AT37 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Upf2A2AT37 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Upf2A2AT37 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Upf2A2AT37 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Upf2A2AT37 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Upf2A2AT37 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Upf2A2AT37 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Upf2A2AT37 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Upf2A2AT37 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Upf2A2AT37 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Upf2A2AT37 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Upf2A2AT37 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Upf2A2AT37 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Upf2A2AT37 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Upf2A2AT37 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Upf2A2AT37 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Upf2A2AT37 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Upf2A2AT37 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Upf2A2AT37 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Upf2A2AT37 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Upf2A2AT37 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Upf2A2AT37 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Upf2A2AT37 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Upf2A2AT37 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Upf2A2AT37 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Upf2A2AT37 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Upf2A2AT37 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Upf2A2AT37 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Upf2A2AT37 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Upf2A2AT37 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Upf2A2AT37 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Upf2A2AT37 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Upf2A2AT37 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Upf2A2AT37 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms