Protein–RNA interactions for Protein: A2ALK8

Ptpn3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn3A2ALK8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn3A2ALK8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn3A2ALK8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn3A2ALK8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ptpn3A2ALK8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ptpn3A2ALK8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ptpn3A2ALK8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn3A2ALK8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn3A2ALK8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn3A2ALK8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn3A2ALK8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpn3A2ALK8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpn3A2ALK8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpn3A2ALK8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpn3A2ALK8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpn3A2ALK8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpn3A2ALK8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpn3A2ALK8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpn3A2ALK8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpn3A2ALK8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpn3A2ALK8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpn3A2ALK8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpn3A2ALK8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpn3A2ALK8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpn3A2ALK8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpn3A2ALK8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpn3A2ALK8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpn3A2ALK8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpn3A2ALK8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpn3A2ALK8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpn3A2ALK8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpn3A2ALK8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpn3A2ALK8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpn3A2ALK8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpn3A2ALK8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpn3A2ALK8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptpn3A2ALK8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptpn3A2ALK8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpn3A2ALK8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpn3A2ALK8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpn3A2ALK8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptpn3A2ALK8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptpn3A2ALK8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptpn3A2ALK8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptpn3A2ALK8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ptpn3A2ALK8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptpn3A2ALK8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms