Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shisal2aA2A9G7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Shisal2aA2A9G7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shisal2aA2A9G7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms