Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms