RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488990.5

TRDMT1-210, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRDMT1, Length 1,301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-210ENST00000488990 SH3KBP1Q96B97 665 aa7.39□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 ALG14Q96F25 216 aa7.39□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 DESI2Q9BSY9 194 aa7.39□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 NDC1Q9BTX1 674 aa7.39□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 BDH2Q9BUT1 245 aa7.39□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa7.39□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 ISCUQ9H1K1 167 aa7.39□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 RASSF1Q9NS23 344 aa7.39□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 B4GALT6Q9UBX8 382 aa7.39□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa7.39□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 SPTBP11277 2137 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 SOCS6O14544 535 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 THAP12O43422 761 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 KIF5CO60282 957 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 KLHL41O60662 606 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 LSM8O95777 96 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
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TRDMT1-210ENST00000488990 CYP11B1P15538 503 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 UGT1A4P22310 534 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 GFERP55789 205 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 GSCP56915 257 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 CDR2Q01850 454 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 TRPC3Q13507 836 aa7.38□□□□□ -1.23
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TRDMT1-210ENST00000488990 ZNF699Q32M78 642 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 IZUMO3Q5VZ72 239 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 LCN10Q6JVE6 187 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
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TRDMT1-210ENST00000488990 UNC45BQ8IWX7 931 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 CRYBG2Q8N1P7 616 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 CATSPER1Q8NEC5 780 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 COG1Q8WTW3 980 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 ROBO4Q8WZ75 1007 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 GBP5Q96PP8 586 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 FEM1AQ9BSK4 669 aa7.38□□□□□ -1.23
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TRDMT1-210ENST00000488990 UCK2Q9BZX2 261 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 CHST8Q9H2A9 424 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 L2HGDHQ9H9P8 463 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 ANLNQ9NQW6 1124 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 LCMT1Q9UIC8 334 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 C16orf96A6NNT2 1141 aa7.37□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.232e-8■■■■■ 37.8
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TRDMT1-210ENST00000488990 FMO1Q01740 532 aa7.37□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 STILQ15468 1287 aa7.37□□□□□ -1.23
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TRDMT1-210ENST00000488990 C3P1Q6ZMU1 363 aa7.37□□□□□ -1.23
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TRDMT1-210ENST00000488990 MRGPREQ86SM8 312 aa7.37□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 KIAA1328Q86T90 577 aa7.37□□□□□ -1.23
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TRDMT1-210ENST00000488990 ALS2CR12Q96Q35 445 aa7.37□□□□□ -1.23
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TRDMT1-210ENST00000488990 HS3ST2Q9Y278 367 aa7.37□□□□□ -1.23
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TRDMT1-210ENST00000488990 TOXO94900 526 aa7.36□□□□□ -1.23
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TRDMT1-210ENST00000488990 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
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TRDMT1-210ENST00000488990 H2AFZP0C0S5 128 aa7.36□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 UNGP13051 313 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 TBX4P57082 545 aa7.36□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 DCAF7P61962 342 aa7.36□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 GPS2Q13227 327 aa7.36□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 VMACQ2NL98 169 aa7.36□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa7.36□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 BSPRYQ5W0U4 402 aa7.36□□□□□ -1.23
TRDMT1-210ENST00000488990 RAP1GAP2Q684P5 730 aa7.36□□□□□ -1.23
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