RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCR7P32248 378 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RRADP55042 308 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSPA14Q0VDF9 509 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEMA3AQ14563 771 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC5A12Q1EHB4 618 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NADK2Q4G0N4 442 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB43Q86YS6 212 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC22A15Q8IZD6 547 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EFCAB3Q8N7B9 438 aa25.26■■□□□ 1.63
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PEX13Q92968 403 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SGSM3Q96HU1 749 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CARD6Q9BX69 1037 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AP1M1Q9BXS5 423 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANAPC5Q9UJX4 755 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF185O15231 689 aa25.25■■□□□ 1.63
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CBSP35520 551 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP1A4Q13733 1029 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf189Q5VU69 101 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MLIPQ5VWP3 458 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RHBDD2Q6NTF9 364 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM26EQ8N5C1 309 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IRAK4Q9NWZ3 460 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A6NL46 340 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPN2P04844 631 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PKLRP30613 574 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OTX2P32243 289 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB28P51157 221 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS6KA1Q15418 735 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VRK3Q8IV63 474 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLIS1Q8NBF1 620 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FDCSPQ8NFU4 85 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPT1CQ8TCG5 803 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PROKR1Q8TCW9 393 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CATSPERZQ9NTU4 200 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TXLNGQ9NUQ3 528 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRPK3Q9UPE1 567 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLCL2Q9UPR0 1127 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDYLQ9Y232 598 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VPS4BO75351 444 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPC4O75487 556 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APOA4P06727 396 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTSBP07858 339 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL22P35268 128 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCDP81605 110 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KYNUQ16719 465 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TLDC1Q6P9B6 456 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJC22Q8N4W6 341 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CFAP61Q8NHU2 1237 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GBP5Q96PP8 586 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUDT9Q9BW91 350 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHRAC1Q9NRG0 131 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VPS4AQ9UN37 437 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IQCF5A8MTL0 148 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPM1O60762 260 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD63P08962 238 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATXN8OSP0DMR3 200 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTPAP49638 278 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCID2Q5JVF3 399 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MEI1Q5TIA1 1274 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UNC5DQ6UXZ4 953 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HPS6Q86YV9 775 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IP6K3Q96PC2 410 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDC1Q9BTX1 674 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR83Q9NYM4 423 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDOR1Q9UHB4 597 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD9P21926 228 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOLR3P41439 243 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSPNQ14714 243 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMED2Q15363 201 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCNG2Q16589 344 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRGPREQ86SM8 312 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM20CQ8IXL6 584 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT222Q8N1A0 295 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC01555Q8NAE3 123 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GALNT11Q8NCW6 608 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC22A18Q96BI1 424 aa25.21■■□□□ 1.63
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