RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNAAF4Q8WXU2 420 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMPDL3BQ92485 455 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MTERF3Q96E29 417 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PKP2Q99959 881 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TEX13BQ9BXU2 312 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DPH5Q9H2P9 285 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SNX25Q9H3E2 840 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TOR3AQ9H497 397 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDH20Q9HBT6 801 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 Q9N2K0 584 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAI2Q9Y5P3 530 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FOXN1O15353 648 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRAF2O60831 178 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NDUFS7O75251 213 aa4.74□□□□□ -1.65
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 GSRP00390 522 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TGFAP01135 160 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SERPING1P05155 500 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SAGP10523 405 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SFNP31947 248 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HSD17B3P37058 310 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAGEB1P43366 347 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NPBWR1P48145 328 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CTSCP53634 463 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MFAP3P55082 362 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ID2Q02363 134 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CUL3Q13618 768 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RABEP1Q15276 862 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 INAQ16352 499 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C1orf186Q6ZWK4 172 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRSS42Q7Z5A4 293 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 APCDD1Q8J025 514 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EXOC6Q8TAG9 804 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC110Q8TBZ0 833 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP4R1Q8TF05 950 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VPS39Q96JC1 886 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SIGLEC11Q96RL6 698 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCYT2Q99447 389 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 NYXQ9GZU5 481 aa4.74□□□□□ -1.65
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 PNPLA3Q9NST1 481 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNK6Q9Y257 313 aa4.74□□□□□ -1.65
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF814B7Z6K7 855 aa4.73□□□□□ -1.65
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 SOCS6O14544 535 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FLRT2O43155 660 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATG13O75143 517 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MT-ATP6P00846 226 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGHV2-70P01814 119 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LCATP04180 440 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMIM18P0DKX4 95 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MYL6BP14649 208 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 EGR4Q05215 589 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VEZF1Q14119 521 aa4.73□□□□□ -1.65
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 RGMBQ6NW40 437 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF367Q7RTV3 350 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARMC9Q7Z3E5 817 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ELMOD2Q8IZ81 293 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BATF2Q8N1L9 274 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KDM8Q8N371 416 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SSMEM1Q8WWF3 244 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SEMA4DQ92854 862 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DTD2Q96FN9 168 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRFN5Q96NI6 719 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAD9AQ99638 391 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF559Q9BR84 538 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa4.73□□□□□ -1.65
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