RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC44A1Q8WWI5 657 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SGF29Q96ES7 293 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 APOLD1Q96LR9 279 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CMKLR1Q99788 373 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAB9BQ9NP90 201 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MSRB1Q9NZV6 116 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPASTQ9UBP0 616 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RABL2BQ9UNT1 228 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KBTBD13C9JR72 458 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WNT9BO14905 357 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ITM2AO43736 263 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR10H2O60403 315 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GLCEO94923 617 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM16O95361 564 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VNN2O95498 520 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLGP00747 810 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CSN3P07498 182 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CTSAP10619 480 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPA1P27694 616 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC6A6P31641 620 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MTCP1P56278 107 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SELENOVP59797 346 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DLK1P80370 383 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TFF2Q03403 129 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAPK11Q15759 364 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CTF1Q16619 201 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FCRLBQ6BAA4 426 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NOTUMQ6P988 496 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DLK2Q6UY11 383 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TTLL10Q6ZVT0 673 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATG9AQ7Z3C6 839 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPR180Q86V85 440 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SIAH3Q8IW03 269 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AQP12AQ8IXF9 295 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR5M8Q8NGP6 311 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIAA1524Q8TCG1 905 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BICD1Q96G01 975 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EEF2KMTQ96G04 330 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF560Q96MR9 790 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PANX3Q96QZ0 392 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TSPY26PQ9H489 355 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLA2Q9H6Q3 261 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C17orf75Q9HAS0 396 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM184CQ9NVA4 438 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NPAP1Q9NZP6 1156 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ELOVL7A1L3X0 281 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR2M5A3KFT3 312 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NEMP2A6NFY4 417 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRC3CA6NJW4 275 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MDM4O15151 490 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NOL3O60936 208 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDNO94850 711 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADRB1P08588 477 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANKRD34CP0C6C1 535 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HOXA5P20719 270 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPL3P39023 403 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMSP52788 366 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NUDT6P53370 316 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GSDMDP57764 484 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC26A5P58743 744 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GALK2Q01415 458 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GAGE2BQ13066 116 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GAGE2EQ4V326 116 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GCNT6Q5T4J0 391 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C12orf60Q5U649 245 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STRIP1Q5VSL9 837 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF410Q86VK4 478 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBC1D21Q8IYX1 336 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AADATQ8N5Z0 425 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLEC1AQ8NC01 280 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIAA0895Q8NCT3 520 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCNYQ8ND76 341 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR52E1Q8NGJ3 308 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms