RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511467.1

PTPN13-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, human

APPRIS P4 TSL 2 BASIC

Gene PTPN13, Length 8,076 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN13-209	ENST00000511467	SLC22A1	O15245	554 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	TEX33	O43247	280 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	GPR143	P51810	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	ERVK-8	P63133	956 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	KCNC4	Q03721	635 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	MPP2	Q14168	576 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	AMZ2	Q86W34	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	LRFN5	Q96NI6	719 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	TLE6	Q9H808	572 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	SIAE	Q9HAT2	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	POLE4	Q9NR33	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	DHRS12	A0PJE2	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467		E9PBE3	544 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	NFIB	O00712	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	AMPD1	P23109	780 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	SEC24C	P53992	1094 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	HERVK_113	P63132	956 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	CBX3	Q13185	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	LRRC3	Q9BY71	257 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	GPR160	Q9UJ42	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	OR5K3	A6NET4	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	SCN2B	O60939	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	INMT	O95050	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	HPR	P00739	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	POU2F2	P09086	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	AR	P10275	920 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	ACTA2	P62736	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	ACTG2	P63267	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	DCST1	Q5T197	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	SMIM5	Q71RC9	77 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	LGI2	Q8N0V4	545 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	LPGAT1	Q92604	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	AIFM3	Q96NN9	605 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	CD180	Q99467	661 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	DSN1	Q9H410	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	MARK1	Q9P0L2	795 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	ING4	Q9UNL4	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	TM7SF2	O76062	418 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	LY86	O95711	162 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	LPL	P06858	475 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	SLC6A6	P31641	620 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	SLCO1A2	P46721	670 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	DSTN	P60981	165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	CYP4F2	P78329	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	CYP4F3	Q08477	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	PNMA5	Q96PV4	448 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	MYNN	Q9NPC7	610 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	B3GALT2	O43825	422 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	RCBTB2	O95199	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	DHFR	P00374	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	EDNRB	P24530	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	CDKN2B	P42772	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	CLCN3	P51790	818 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	POLE2	P56282	527 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	HSPB2	Q16082	182 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN13-209	ENST00000511467	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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