RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429762.7

VSX1-205, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX1, Length 1,977 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-205ENST00000429762 PDHA2P29803 388 aa21.64■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 CDK3Q00526 305 aa21.64■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 GTF2H3Q13889 308 aa21.64■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 TMEM198Q66K66 360 aa21.64■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa21.64■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa21.64■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa21.64■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 ZNF547Q8IVP9 402 aa21.64■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 KIF2BQ8N4N8 673 aa21.64■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 COX14Q96I36 57 aa21.64■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 CDK15Q96Q40 435 aa21.64■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa21.64■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 FBRSQ9HAH7 460 aa21.64■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 SAR1AQ9NR31 198 aa21.64■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa21.64■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 QSOX1O00391 747 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 KPNA5O15131 536 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 CCDC22O60826 627 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 HK2P52789 917 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 ARHGAP8P85298 464 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 BCL7AQ4VC05 210 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 SPDYAQ5MJ70 313 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 EOGTQ5NDL2 527 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 ASB11Q8WXH4 323 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 FAM131CQ96AQ9 280 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 RHBDF1Q96CC6 855 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 CCDC106Q9BWC9 280 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 ZNF225Q9UK10 706 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 SLC5A10A0PJK1 596 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 SLCO2B1O94956 709 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 ENO1P06733 434 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 GLULP15104 373 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 RPIAP49247 311 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 RPS21P63220 83 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 CFAP206Q8IYR0 622 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 DEFB123Q8N688 67 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 TEX9Q8N6V9 391 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 OR52B6Q8NGF0 335 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 TMEM159Q96B96 161 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 ARL15Q9NXU5 204 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 MMP17Q9ULZ9 603 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 TIMM22Q9Y584 194 aa21.63■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 AZIN1O14977 448 aa21.62■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 UNC5CO95185 931 aa21.62■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 ACADMP11310 421 aa21.62■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 BDKRB1P46663 353 aa21.62■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 CPA2P48052 419 aa21.62■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 SGCGQ13326 291 aa21.62■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 TMEM259Q4ZIN3 620 aa21.62■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 XKR5Q6UX68 686 aa21.62■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 ACAD11Q709F0 780 aa21.62■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 HMGB4Q8WW32 186 aa21.62■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 BTRCQ9Y297 605 aa21.62■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 CAPN14A8MX76 684 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 C8GP07360 202 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 GABRG2P18507 467 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 GTF2H2Q13888 395 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 UGT3A2Q3SY77 523 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 SULT1C3Q6IMI6 304 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 CATSPER2Q96P56 530 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 SLC12A9Q9BXP2 914 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 SLC17A9Q9BYT1 436 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 RDH14Q9HBH5 336 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 PARVBQ9HBI1 364 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 TM7SF3Q9NS93 570 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 TXLNGQ9NUQ3 528 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 C2orf42Q9NWW7 574 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 TRIOO75962 3097 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 TRPC5OSA6NMA1 111 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 SLC31A1O15431 190 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 CRCPO75575 148 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 POP7O75817 140 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 OR4F21O95013 312 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 CCSMST1Q4G0I0 132 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 FBXO43Q4G163 708 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 KANK2Q63ZY3 851 aa21.61■■□□□ 1.05
VSX1-205ENST00000429762 HORMAD1Q86X24 394 aa21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms