RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 CDKN2CP42773 168 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 GNPDA1P46926 289 aa6.39□□□□□ -1.39
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SBNO1-202ENST00000420886 RAB12Q6IQ22 244 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 LSMEM1Q8N8F7 131 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 C4orf32Q8N8J7 132 aa6.39□□□□□ -1.39
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SBNO1-202ENST00000420886 SLC28A2O43868 658 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 ADAM23O75077 832 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 LINC00032P0C843 101 aa6.39□□□□□ -1.39
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SBNO1-202ENST00000420886 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
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SBNO1-202ENST00000420886 TTLL9Q3SXZ7 439 aa6.39□□□□□ -1.39
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SBNO1-202ENST00000420886 SLC26A9Q7LBE3 791 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 SSX6Q7RTT6 188 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.39□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 TESCQ96BS2 214 aa6.39□□□□□ -1.39
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