RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520961.1

RBM12B-206, Transcript of RNA binding motif protein 12B, human

TSL 3

Gene RBM12B, Length 507 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM12B-206	ENST00000520961	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	OR2M5	A3KFT3	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	OGG1	O15527	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	TMCC2	O75069	709 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	PLA2G4B	P0C869	781 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	GPR143	P51810	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	TMEM187	Q14656	261 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	MEP1A	Q16819	746 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	ZNF534	Q76KX8	674 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	FGF22	Q9HCT0	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	SIX2	Q9NPC8	291 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	PLK4	O00444	970 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	SCAMP1	O15126	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	SLC22A2	O15244	555 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	LIF	P15018	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	TMEM11	P17152	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	ACADL	P28330	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	KCNJ10	P78508	379 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	CEP97	Q8IW35	865 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	PDILT	Q8N807	584 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	OR2T12	Q8NG77	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	STK36	Q9NRP7	1315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961		A0A087X002	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	GPR137B	O60478	399 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	TMEM63A	O94886	807 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	GCNT3	O95395	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	CEACAM1	P13688	526 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	SELL	P14151	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	CKMT2	P17540	419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	KRT9	P35527	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	MFAP5	Q13361	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	ZNF653	Q96CK0	615 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	CACNG5	Q9UF02	275 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	CACNA1F	O60840	1977 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	ACTN1	P12814	892 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	ITGA3	P26006	1051 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	THOP1	P52888	689 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	TMEM198	Q66K66	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	PLD3	Q8IV08	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	TMEM143	Q96AN5	459 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	GAD1	Q99259	594 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	PELI2	Q9HAT8	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	MIOS	Q9NXC5	875 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	ARHGEF9	O43307	516 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	CSPG5	O95196	566 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	CLPTM1	O96005	669 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	CBL	P22681	906 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	TUBB2A	Q13885	445 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	SLC1A5	Q15758	541 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1313.3 ms