RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 GGPS1O95749 300 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SLC25A27O95847 323 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 IGHV2-70P01814 119 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GALTP07902 379 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 FGF4P08620 206 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 H2AFZP0C0S5 128 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SRGAP2BP0DMP2 458 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PTAFRP25105 342 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 UQCRC1P31930 480 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PCGF2P35227 344 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 HPCAL1P37235 193 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PPP3CCP48454 512 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ACTR3P61158 418 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SP2Q02086 613 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF91Q05481 1191 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 FSTL1Q12841 308 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ART3Q13508 389 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SGO1Q5FBB7 561 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 LIN9Q5TKA1 542 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ARMC6Q6NXE6 501 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM81Q6P7N7 255 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 H2AFVQ71UI9 128 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CROCCP2Q86T23 111 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ARMC8Q8IUR7 673 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MAP4K3Q8IVH8 894 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 DENND6AQ8IWF6 608 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 KDM1BQ8NB78 822 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MOSPD2Q8NHP6 518 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 JADE3Q92613 823 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 RIPOR3Q96MK2 946 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 LMF1Q96S06 567 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SIX2Q9NPC8 291 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 C19orf12Q9NSK7 152 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZMYM5Q9UJ78 669 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 RAB23Q9ULC3 237 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CDC14AQ9UNH5 594 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TTLL8A6PVC2 850 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 K7ERQ8 282 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 LDLRAD4O15165 306 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 RHOBTB1O94844 696 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MFN2O95140 757 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZWINTO95229 277 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ERBB2P04626 1255 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ABCB4P21439 1286 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CD79BP40259 229 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 STAT5BP51692 787 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ERVFC1P60507 584 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 AP1S1P61966 158 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PPP3CAQ08209 521 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 C17orf67Q0P5P2 114 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SLC14A1Q13336 389 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PPIL2Q13356 520 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GRB7Q14451 532 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF846Q147U1 533 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GPR139Q6DWJ6 353 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CFAP77Q6ZQR2 320 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TPGS1Q6ZTW0 290 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 LHFPL3Q86UP9 236 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PDPRQ8NCN5 879 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 OR2W6PQ8NHA6 318 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PTERQ96BW5 349 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SLC10A4Q96EP9 437 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SERPINB11Q96P15 392 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MMP19Q99542 508 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 HINFPQ9BQA5 517 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 FAM213AQ9BRX8 229 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 BTBD10Q9BSF8 475 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TUBB6Q9BUF5 446 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 RGS18Q9NS28 235 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ADPRHL2Q9NX46 363 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CDH9Q9ULB4 789 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CENPXA8MT69 81 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ANKRD63C9JTQ0 380 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 K7ERI5 159 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GSC2O15499 205 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SNAP91O60641 907 aa4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 188 ms