RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598840.5

SAE1-209, Transcript of SUMO1 activating enzyme subunit 1, human

TSL 5 BASIC

Gene SAE1, Length 1,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SAE1-209	ENST00000598840	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SAE1-209	ENST00000598840	MEGF6	O75095	1541 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SAE1-209	ENST00000598840	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SAE1-209	ENST00000598840	DCTN1	Q14203	1278 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SAE1-209	ENST00000598840	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
SAE1-209	ENST00000598840	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
SAE1-209	ENST00000598840	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SAE1-209	ENST00000598840	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
SAE1-209	ENST00000598840	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
SAE1-209	ENST00000598840	NRAP	Q86VF7	1730 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SAE1-209	ENST00000598840	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SAE1-209	ENST00000598840	IL2RB	P14784	551 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SAE1-209	ENST00000598840	SLFN5	Q08AF3	891 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SAE1-209	ENST00000598840	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SAE1-209	ENST00000598840	MCM10	Q7L590	875 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SAE1-209	ENST00000598840	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
SAE1-209	ENST00000598840	SPG7	Q9UQ90	795 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SAE1-209	ENST00000598840	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
SAE1-209	ENST00000598840		E9PSI1	815 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SAE1-209	ENST00000598840	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SAE1-209	ENST00000598840	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	32.56	■■■□□ 2.8	8e-7	■□□□□ 8.8
SAE1-209	ENST00000598840	USP21	Q9UK80	565 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SAE1-209	ENST00000598840	MAP3K5	Q99683	1374 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SAE1-209	ENST00000598840	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SAE1-209	ENST00000598840	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SAE1-209	ENST00000598840	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
SAE1-209	ENST00000598840	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SAE1-209	ENST00000598840	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SAE1-209	ENST00000598840	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SAE1-209	ENST00000598840	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SAE1-209	ENST00000598840	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SAE1-209	ENST00000598840	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
SAE1-209	ENST00000598840	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
SAE1-209	ENST00000598840	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.8
SAE1-209	ENST00000598840	AFF2	P51816	1311 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SAE1-209	ENST00000598840	IL16	Q14005	1332 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SAE1-209	ENST00000598840	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SAE1-209	ENST00000598840	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
SAE1-209	ENST00000598840	VPS72	Q15906	364 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SAE1-209	ENST00000598840	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SAE1-209	ENST00000598840	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
SAE1-209	ENST00000598840	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SAE1-209	ENST00000598840	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
SAE1-209	ENST00000598840	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SAE1-209	ENST00000598840	LGR6	Q9HBX8	967 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SAE1-209	ENST00000598840	CYP27B1	O15528	508 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SAE1-209	ENST00000598840	PHKG2	P15735	406 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SAE1-209	ENST00000598840	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SAE1-209	ENST00000598840	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
SAE1-209	ENST00000598840	DISP2	A7MBM2	1401 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SAE1-209	ENST00000598840	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SAE1-209	ENST00000598840	IFT57	Q9NWB7	429 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SAE1-209	ENST00000598840	GNAI1	P63096	354 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SAE1-209	ENST00000598840	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
SAE1-209	ENST00000598840	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SAE1-209	ENST00000598840	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SAE1-209	ENST00000598840	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
SAE1-209	ENST00000598840	CFAP44	Q96MT7	982 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SAE1-209	ENST00000598840	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SAE1-209	ENST00000598840	ZNF853	P0CG23	659 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SAE1-209	ENST00000598840	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SAE1-209	ENST00000598840	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
SAE1-209	ENST00000598840	EXOC5	O00471	708 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SAE1-209	ENST00000598840	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
SAE1-209	ENST00000598840	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SAE1-209	ENST00000598840	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
SAE1-209	ENST00000598840	MBIP	Q9NS73	344 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SAE1-209	ENST00000598840	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SAE1-209	ENST00000598840	CHL1	O00533	1208 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SAE1-209	ENST00000598840	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
SAE1-209	ENST00000598840	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
SAE1-209	ENST00000598840	DCAF5	Q96JK2	942 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SAE1-209	ENST00000598840	TEF	Q10587	303 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SAE1-209	ENST00000598840	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
SAE1-209	ENST00000598840	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
SAE1-209	ENST00000598840	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SAE1-209	ENST00000598840	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
SAE1-209	ENST00000598840	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
SAE1-209	ENST00000598840	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
SAE1-209	ENST00000598840	DDB1	Q16531	1140 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SAE1-209	ENST00000598840	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SAE1-209	ENST00000598840	LRRC37A3	O60309	1634 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SAE1-209	ENST00000598840	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SAE1-209	ENST00000598840	ATRN	O75882	1429 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SAE1-209	ENST00000598840	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
SAE1-209	ENST00000598840	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SAE1-209	ENST00000598840		A0A0G2JS52	829 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SAE1-209	ENST00000598840	MYT1	Q01538	1121 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SAE1-209	ENST00000598840	TNS2	Q63HR2	1409 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SAE1-209	ENST00000598840	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
SAE1-209	ENST00000598840	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
SAE1-209	ENST00000598840	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SAE1-209	ENST00000598840	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SAE1-209	ENST00000598840	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SAE1-209	ENST00000598840	BTBD11	A6QL63	1104 aa		32.26	■■■□□ 2.76
SAE1-209	ENST00000598840	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.26	■■■□□ 2.76
SAE1-209	ENST00000598840	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		32.26	■■■□□ 2.76
SAE1-209	ENST00000598840	GLI3	P10071	1580 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SAE1-209	ENST00000598840	CABP4	P57796	275 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SAE1-209	ENST00000598840	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75

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