RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 PTK2Q05397 1052 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 GAS6Q14393 721 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 Q8N3U1 123 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 PNMA1Q8ND90 353 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 MBIPQ9NS73 344 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 RAB15P59190 212 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 ADAM32Q8TC27 787 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 ADD1P35611 737 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 NEDD1Q8NHV4 660 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 PTGIRP43119 386 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 IGF1RP08069 1367 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 USP17L8P0C7I0 530 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 BCRP11274 1271 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 H7C1W4 665 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 LILRA1O75019 489 aa6.26□□□□□ -1.41
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RBM39-242ENST00000498280 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 LRRC4BQ9NT99 713 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 GPC1P35052 558 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 RFC5P40937 340 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 DDRGK1Q96HY6 314 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 GPR25O00155 361 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 RHOQP17081 205 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 FURINP09958 794 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 BAG6P46379 1132 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 CYLDQ9NQC7 956 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 ESPNB1AK53 854 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 MX2P20592 715 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RBM39-242ENST00000498280 ACDQ96AP0 544 aa6.22□□□□□ -1.41
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RBM39-242ENST00000498280 KRBA1A5PL33 1030 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 OIP5O43482 229 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 MAP2K3P46734 347 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 DBN1Q16643 649 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 IL27Q8NEV9 243 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 FBXO45P0C2W1 286 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 NLRP3Q96P20 1036 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 GPR37L1O60883 481 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 CCDC125Q86Z20 511 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 PIK3R2O00459 728 aa6.16□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 SCTRP47872 440 aa6.16□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 WDR44Q5JSH3 913 aa6.16□□□□□ -1.42
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RBM39-242ENST00000498280 NBPF15Q8N660 670 aa6.16□□□□□ -1.42
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RBM39-242ENST00000498280 A0A1W2PRU2 124 aa6.15□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 POU4F2Q12837 409 aa6.15□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 CLN3Q13286 438 aa6.15□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.15□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.15□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 BCANQ96GW7 911 aa6.15□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 RRAGCQ9HB90 399 aa6.15□□□□□ -1.42
RBM39-242ENST00000498280 ZBBXA8MT70 800 aa6.14□□□□□ -1.43
RBM39-242ENST00000498280 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.14□□□□□ -1.43
RBM39-242ENST00000498280 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RBM39-242ENST00000498280 F11P03951 625 aa6.14□□□□□ -1.43
RBM39-242ENST00000498280 COL8A1P27658 744 aa6.14□□□□□ -1.43
RBM39-242ENST00000498280 ERVK-9P63128 1117 aa6.14□□□□□ -1.43
RBM39-242ENST00000498280 NEUROD2Q15784 382 aa6.14□□□□□ -1.43
RBM39-242ENST00000498280 RNF20Q5VTR2 975 aa6.14□□□□□ -1.43
RBM39-242ENST00000498280 ZNF592Q92610 1267 aa6.14□□□□□ -1.43
RBM39-242ENST00000498280 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
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