RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384154.1

RNU6-190P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 190, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-190P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-190P-201ENST00000384154 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 ALG2Q9H553 416 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 AGERQ15109 404 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 UCN2Q96RP3 112 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 ITGA6P23229 1130 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 FOXK2Q01167 660 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 PTK2Q05397 1052 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 ERFEQ4G0M1 354 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 KANK3Q6NY19 840 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 ARID3AQ99856 593 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 HOMEZQ8IX15 550 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF592Q92610 1267 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 ADAM32Q8TC27 787 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 WHAMMQ8TF30 809 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-190P-201ENST00000384154 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 CBLBQ13191 982 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 SEMA3FQ13275 785 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 CFAP70Q5T0N1 1121 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 SVOPQ8N4V2 548 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 SV2AQ7L0J3 742 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 RNF217Q8TC41 542 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 CARD14Q9BXL6 1004 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 FIGNL2A6NMB9 653 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 VWA5B2Q8N398 1253 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC10A4Q96EP9 437 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 PIK3CDO00329 1044 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 ATP9BO43861 1147 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 IRS1P35568 1242 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZBTB33Q86T24 672 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 PBXIP1Q96AQ6 731 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 ADAMTS2O95450 1211 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 GAS6Q14393 721 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 NBPF20Q3BBV1 942 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 GMCL1Q96IK5 515 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 LRRC4BQ9NT99 713 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-190P-201ENST00000384154 USP17L3A6NCW0 530 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 USP17L4A6NCW7 530 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 USP17L5A8MUK1 530 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 GPAT2Q6NUI2 795 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 USP17L2Q6R6M4 530 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 LYPD4Q6UWN0 246 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 USP17L1Q7RTZ2 530 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 RNF135Q8IUD6 432 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 CEP126Q9P2H0 1117 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 CHIC2Q9UKJ5 165 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 ESPNB1AK53 854 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 LILRA1O75019 489 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLFNL1Q499Z3 407 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 PHTF2Q8N3S3 785 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 ITGB2P05107 769 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 ADH1AP07327 375 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 SKIP12755 728 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 MARSP56192 900 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 PLPP7Q8NBV4 271 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 AGBL1Q96MI9 1066 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 CDC14CA4D256 554 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 ADAM23O75077 832 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 SEPT12Q8IYM1 358 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 PTGIRP43119 386 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 RELBQ01201 579 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-190P-201ENST00000384154 MAP7D1Q3KQU3 841 aa5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.2 ms