RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.72■■□□□ 1.55
PPP1CC-201ENST00000335007 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.72■■□□□ 1.55
PPP1CC-201ENST00000335007 ERC2O15083 957 aa24.71■■□□□ 1.55
PPP1CC-201ENST00000335007 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PPP1CC-201ENST00000335007 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.7■■□□□ 1.55
PPP1CC-201ENST00000335007 RNF214Q8ND24 703 aa24.7■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 MCM2P49736 904 aa24.69■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.69■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 GGT6Q6P531 493 aa24.69■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 STK26Q9P289 416 aa24.69■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.68■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 HMOX1P09601 288 aa24.68■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 MYRIPQ8NFW9 859 aa24.68■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 PHF14O94880 888 aa24.67■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 BRD1O95696 1058 aa24.67■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 POLKQ9UBT6 870 aa24.67■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.541e-8■■■□□ 15.3
PPP1CC-201ENST00000335007 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.67■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 CEP85Q6P2H3 762 aa24.66■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 TMX3Q96JJ7 454 aa24.66■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.65■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24.65■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.65■■□□□ 1.54
PPP1CC-201ENST00000335007 NEK4P51957 841 aa24.63■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 CUL4AQ13619 759 aa24.63■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.63■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 PRAM1Q96QH2 718 aa24.63■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 ARID3AQ99856 593 aa24.63■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 UVSSAQ2YD98 709 aa24.62■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 RGS12O14924 1447 aa24.61■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 RTL1A6NKG5 1358 aa24.61■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.61■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.61■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.6■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 CABP1Q9NZU7 370 aa24.6■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 MSH6P52701 1360 aa24.6■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 MCCP23508 829 aa24.59■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 APBB1O00213 710 aa24.59■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 IL13P35225 146 aa24.59■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.537e-10■■■□□ 18.8
PPP1CC-201ENST00000335007 CDK19Q9BWU1 502 aa24.58■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 ATP7BP35670 1465 aa24.58■■□□□ 1.53
PPP1CC-201ENST00000335007 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.57■■□□□ 1.52
PPP1CC-201ENST00000335007 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
PPP1CC-201ENST00000335007 HMMRO75330 724 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP1CC-201ENST00000335007 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP1CC-201ENST00000335007 DMTNQ08495 405 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP1CC-201ENST00000335007 FBLN1P23142 703 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP1CC-201ENST00000335007 ANAPC15P60006 121 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP1CC-201ENST00000335007 PTPRCP08575 1304 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP1CC-201ENST00000335007 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.527e-10■□□□□ 10.8
PPP1CC-201ENST00000335007 PDE1AP54750 535 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP1CC-201ENST00000335007 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP1CC-201ENST00000335007 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP1CC-201ENST00000335007 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP1CC-201ENST00000335007 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM83GA6ND36 823 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP1CC-201ENST00000335007 MEIS3Q99687 375 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP1CC-201ENST00000335007 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PPP1CC-201ENST00000335007 SSH2Q76I76 1423 aa24.52■■□□□ 1.52
PPP1CC-201ENST00000335007 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 IDI1Q13907 227 aa24.51■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.51■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC183Q5T5S1 534 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 USP48Q86UV5 1035 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 SPTLC3Q9NUV7 552 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 USP25Q9UHP3 1055 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 TMEM87AQ8NBN3 555 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 KIF3AQ9Y496 699 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 KIAA0232Q92628 1395 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 ADCY5O95622 1261 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 IL17RAQ96F46 866 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 DCTN1Q14203 1278 aa24.48■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 PALD1Q9ULE6 856 aa24.48■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.47■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.47■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PPP1CC-201ENST00000335007 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms