RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.26■■□□□ 1.79
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.25■■□□□ 1.79
UBE2B-201ENST00000265339 FAM83GA6ND36 823 aa26.24■■□□□ 1.79
UBE2B-201ENST00000265339 GOLGA2Q08379 1002 aa26.24■■□□□ 1.79
UBE2B-201ENST00000265339 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
UBE2B-201ENST00000265339 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
UBE2B-201ENST00000265339 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.21■■□□□ 1.79
UBE2B-201ENST00000265339 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
UBE2B-201ENST00000265339 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.2■■□□□ 1.78
UBE2B-201ENST00000265339 JCADQ9P266 1359 aa26.18■■□□□ 1.78
UBE2B-201ENST00000265339 SLFN5Q08AF3 891 aa26.18■■□□□ 1.78
UBE2B-201ENST00000265339 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
UBE2B-201ENST00000265339 WDR63Q8IWG1 891 aa26.18■■□□□ 1.78
UBE2B-201ENST00000265339 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.18■■□□□ 1.78
UBE2B-201ENST00000265339 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
UBE2B-201ENST00000265339 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
UBE2B-201ENST00000265339 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
UBE2B-201ENST00000265339 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.15■■□□□ 1.78
UBE2B-201ENST00000265339 ADAMTS2O95450 1211 aa26.15■■□□□ 1.78
UBE2B-201ENST00000265339 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.15■■□□□ 1.78
UBE2B-201ENST00000265339 E9PSI1 815 aa26.15■■□□□ 1.78
UBE2B-201ENST00000265339 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
UBE2B-201ENST00000265339 HSPA1LP34931 641 aa26.14■■□□□ 1.78
UBE2B-201ENST00000265339 BTG4Q9NY30 223 aa26.14■■□□□ 1.78
UBE2B-201ENST00000265339 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.14■■□□□ 1.77
UBE2B-201ENST00000265339 STRN4Q9NRL3 753 aa26.14■■□□□ 1.77
UBE2B-201ENST00000265339 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.13■■□□□ 1.77
UBE2B-201ENST00000265339 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
UBE2B-201ENST00000265339 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.12■■□□□ 1.77
UBE2B-201ENST00000265339 MEGF6O75095 1541 aa26.12■■□□□ 1.77
UBE2B-201ENST00000265339 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
UBE2B-201ENST00000265339 PDE4AP27815 886 aa26.1■■□□□ 1.77
UBE2B-201ENST00000265339 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
UBE2B-201ENST00000265339 EVA1CP58658 441 aa26.1■■□□□ 1.77
UBE2B-201ENST00000265339 GSE1Q14687 1217 aa26.1■■□□□ 1.77
UBE2B-201ENST00000265339 DCTN1Q14203 1278 aa26.1■■□□□ 1.77
UBE2B-201ENST00000265339 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.09■■□□□ 1.77
UBE2B-201ENST00000265339 NRAPQ86VF7 1730 aa26.08■■□□□ 1.77
UBE2B-201ENST00000265339 IL16Q14005 1332 aa26.08■■□□□ 1.77
UBE2B-201ENST00000265339 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.08■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 CRB1P82279 1406 aa26.07■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 MAP3K5Q99683 1374 aa26.07■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 MCM10Q7L590 875 aa26.07■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.07■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.06■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 LRP6O75581 1613 aa26.06■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.05■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.05■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.04■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.04■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC37A3O60309 1634 aa26.04■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.04■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.04■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 SLIT2O94813 1529 aa26.03■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 BACH2Q9BYV9 841 aa26.03■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.02■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.02■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
UBE2B-201ENST00000265339 IFT57Q9NWB7 429 aa25.99■■□□□ 1.75
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF853P0CG23 659 aa25.99■■□□□ 1.75
UBE2B-201ENST00000265339 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.99■■□□□ 1.75
UBE2B-201ENST00000265339 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
UBE2B-201ENST00000265339 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
UBE2B-201ENST00000265339 GNAI1P63096 354 aa25.97■■□□□ 1.75
UBE2B-201ENST00000265339 IL17REQ8NFR9 667 aa25.97■■□□□ 1.75
UBE2B-201ENST00000265339 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
UBE2B-201ENST00000265339 C8orf37Q96NL8 207 aa25.97■■□□□ 1.75
UBE2B-201ENST00000265339 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.97■■□□□ 1.75
UBE2B-201ENST00000265339 CFAP44Q96MT7 982 aa25.97■■□□□ 1.75
UBE2B-201ENST00000265339 SPG7Q9UQ90 795 aa25.97■■□□□ 1.75
UBE2B-201ENST00000265339 IL2RBP14784 551 aa25.96■■□□□ 1.75
UBE2B-201ENST00000265339 NFKBIBQ15653 356 aa25.95■■□□□ 1.75
UBE2B-201ENST00000265339 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.95■■□□□ 1.75
UBE2B-201ENST00000265339 WNK3Q9BYP7 1800 aa25.95■■□□□ 1.75
UBE2B-201ENST00000265339 MBIPQ9NS73 344 aa25.95■■□□□ 1.74
UBE2B-201ENST00000265339 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.95■■□□□ 1.74
UBE2B-201ENST00000265339 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.94■■□□□ 1.74
UBE2B-201ENST00000265339 NGLY1Q96IV0 654 aa25.93■■□□□ 1.74
UBE2B-201ENST00000265339 DISP2A7MBM2 1401 aa25.93■■□□□ 1.74
UBE2B-201ENST00000265339 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
UBE2B-201ENST00000265339 LGR6Q9HBX8 967 aa25.93■■□□□ 1.74
UBE2B-201ENST00000265339 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.92■■□□□ 1.74
UBE2B-201ENST00000265339 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.92■■□□□ 1.74
UBE2B-201ENST00000265339 CYP27B1O15528 508 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2B-201ENST00000265339 MS4A1P11836 297 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2B-201ENST00000265339 PHKG2P15735 406 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2B-201ENST00000265339 CHL1O00533 1208 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2B-201ENST00000265339 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2B-201ENST00000265339 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2B-201ENST00000265339 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.9■■□□□ 1.74
UBE2B-201ENST00000265339 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
UBE2B-201ENST00000265339 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms