RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592444.5

ERCC1-216, Transcript of ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunit, human

TSL 2

Gene ERCC1, Length 449 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC1-216	ENST00000592444	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	RASA4B	C9J798	803 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	RASA4	O43374	803 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	WISP2	O76076	250 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	TOX	O94900	526 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	MOCS3	O95396	460 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	TIAF1	O95411	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ECEL1	O95672	775 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	FGF1	P05230	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	RALA	P11233	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	PCSK2	P16519	638 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	MST1	P26927	711 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	MAP3K7CL	P57077	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	RBP5	P82980	135 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	MYL5	Q02045	173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	INPP5A	Q14642	412 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	MPP7	Q5T2T1	576 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ADGRF1	Q5T601	910 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	SV2B	Q7L1I2	683 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ERMN	Q8TAM6	284 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	PATE1	Q8WXA2	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	NCSTN	Q92542	709 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	EDEM1	Q92611	657 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	PDXP	Q96GD0	296 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	NDC1	Q9BTX1	674 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	HDAC8	Q9BY41	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	RYR2	Q92736	4967 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444		A8MXQ7	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	TISP43	B9A030	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	TOR1B	O14657	336 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	KRT34	O76011	436 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	PLS3	P13797	630 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	GAP43	P17677	238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	CHRNA3	P32297	505 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	LRRC63	Q05C16	580 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	PAK1	Q13153	545 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	IL11RA	Q14626	422 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	DLG2	Q15700	870 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	DYM	Q7RTS9	669 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	TMEM139	Q8IV31	216 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	RNF214	Q8ND24	703 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	HPDL	Q96IR7	371 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	PARVG	Q9HBI0	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	KRT82	Q9NSB4	513 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	PANK4	Q9NVE7	773 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC1-216	ENST00000592444	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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