RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	ADM5	C9JUS6	153 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	NFKBIE	O00221	500 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	ACOX3	O15254	700 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	F9	P00740	461 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	SCNN1A	P37088	669 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	KCNA7	Q96RP8	456 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	PIP5K1B	O14986	540 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	PIRT	P0C851	137 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	ECT2L	Q008S8	904 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	KCTD11	Q693B1	232 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	DPF3	Q92784	378 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	SENP8	Q96LD8	212 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	VWA7	Q9Y334	891 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	PPP6C	O00743	305 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	NME4	O00746	187 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	KCNH1	O95259	989 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	LDLR	P01130	860 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	WNT3A	P56704	352 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	COPZ1	P61923	177 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	PPIL2	Q13356	520 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	RABL3	Q5HYI8	236 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	STK32C	Q86UX6	486 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	PCED1B	Q96HM7	432 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	VPS35	Q96QK1	796 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157		I6L893	689 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	TSPAN9	O75954	239 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	OXTR	P30559	389 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	CBLB	Q13191	982 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	TAC4	Q86UU9	113 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	TFAP2C	Q92754	450 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	C3orf30	Q96M34	536 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	HMG20A	Q9NP66	347 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM50B	Q9Y247	325 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	CDH1	P12830	882 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	CD86	P42081	329 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	TMBIM6	P55061	237 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	GLRX5	Q86SX6	157 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	SEPT8	Q92599	483 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	SP110	Q9HB58	689 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	GJD2	Q9UKL4	321 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	DERA	Q9Y315	318 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	CEP350	Q5VT06	3117 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157		B8ZZF3	427 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	PTGES3L	E9PB15	166 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	UBXN8	O00124	270 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	ARPC2	O15144	300 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	B4GAT1	O43505	415 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	ASNA1	O43681	348 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	SNAP29	O95721	258 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	HLA-DQB2	P05538	268 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	TUBA3C	Q13748	450 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SSUH2-208	ENST00000455157	GRB7	Q14451	532 aa		11.29	□□□□□ -0.6

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