RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 RPL22P35268 128 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
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ACTB-206ENST00000443528 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
ACTB-206ENST00000443528 PYCR3Q53H96 274 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTB-206ENST00000443528 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
ACTB-206ENST00000443528 PDPK2PQ6A1A2 396 aa15.59■□□□□ 0.09
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ACTB-206ENST00000443528 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
ACTB-206ENST00000443528 SLC35F3Q8IY50 421 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTB-206ENST00000443528 BRSK1Q8TDC3 778 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTB-206ENST00000443528 ARFGAP3Q9NP61 516 aa15.59■□□□□ 0.09
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ACTB-206ENST00000443528 KLK13Q9UKR3 277 aa15.59■□□□□ 0.09
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ACTB-206ENST00000443528 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
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ACTB-206ENST00000443528 HOMER3Q9NSC5 361 aa15.58■□□□□ 0.08
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ACTB-206ENST00000443528 GPR34Q9UPC5 381 aa15.58■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 PKP3Q9Y446 797 aa15.58■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP15.58■□□□□ 0.086e-21■■■□□ 14.8
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ACTB-206ENST00000443528 UGT1A3P35503 534 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 UGT1A5P35504 534 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 ACTN2P35609 894 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 CLDN6P56747 220 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 CTBSQ01459 385 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 SEMA5AQ13591 1074 aa15.57■□□□□ 0.08
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ACTB-206ENST00000443528 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
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ACTB-206ENST00000443528 FAM46DQ8NEK8 389 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 OR4K2Q8NGD2 314 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 OR13C4Q8NGS5 318 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 ACTRT1Q8TDG2 376 aa15.57■□□□□ 0.08
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ACTB-206ENST00000443528 OR2M4Q96R27 311 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 AP1M1Q9BXS5 423 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 UGT1A7Q9HAW7 530 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 UGT1A10Q9HAW8 530 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 UGT1A8Q9HAW9 530 aa15.57■□□□□ 0.08
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ACTB-206ENST00000443528 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 SIRPGQ9P1W8 387 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 GULP1Q9UBP9 304 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 PRKAB1Q9Y478 270 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 GPSM3Q9Y4H4 160 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa15.56■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
ACTB-206ENST00000443528 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
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