RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-208ENST00000481518 SLC30A9Q6PML9 568 aa22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 RCOR2Q8IZ40 523 aa22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ACRBPQ8NEB7 543 aa22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 OR6C4Q8NGE1 309 aa22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 EXD1Q8NHP7 514 aa22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 FGF11Q92914 225 aa22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 TEKT5Q96M29 485 aa22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 HERPUD2Q9BSE4 406 aa22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 GSDMCQ9BYG8 508 aa22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ASCL3Q9NQ33 180 aa22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 APPL1Q9UKG1 709 aa22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
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PSME4-208ENST00000481518 D6RAR5 112 aa22.88■■□□□ 1.25
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PSME4-208ENST00000481518 ACTN2P35609 894 aa22.88■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 SLC14A2Q15849 920 aa22.88■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 CCNJLQ8IV13 435 aa22.88■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 PATE1Q8WXA2 126 aa22.88■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 P3H4Q92791 437 aa22.88■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 OR2M4Q96R27 311 aa22.88■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 LRRN3Q9H3W5 708 aa22.88■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 UBP1Q9NZI7 540 aa22.88■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 LRIT1Q9P2V4 623 aa22.88■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 SHOC2Q9UQ13 582 aa22.88■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ITPR1Q14643 2758 aa22.88■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 PMPCBO75439 489 aa22.87■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 PYGLP06737 847 aa22.87■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 CDK18Q07002 472 aa22.87■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 PPP2R5EQ16537 467 aa22.87■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 PYCR3Q53H96 274 aa22.87■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 SPRED1Q7Z699 444 aa22.87■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 PDZD3Q86UT5 571 aa22.87■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 TMEM139Q8IV31 216 aa22.87■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.87■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 CCHCR1Q8TD31 782 aa22.87■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa22.87■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 GRAMD1AQ96CP6 724 aa22.87■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
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PSME4-208ENST00000481518 HEMGNQ9BXL5 484 aa22.87■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.87■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 FAM83DQ9H4H8 585 aa22.87■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 PKD2L2Q9NZM6 624 aa22.87■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa22.86■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 FAM208BQ5VWN6 2430 aa22.86■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 SLC4A1P02730 911 aa22.86■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 NFKB1P19838 968 aa22.86■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 BBS12Q6ZW61 710 aa22.86■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 GPR26Q8NDV2 337 aa22.86■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 CDH19Q9H159 772 aa22.86■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa22.86■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 MAGEE1Q9HCI5 957 aa22.86■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ZNF711Q9Y462 761 aa22.86■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 PRKAB1Q9Y478 270 aa22.86■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.86■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 SPO11Q9Y5K1 396 aa22.86■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 LAMA5O15230 3695 aa22.85■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 RGSL1A5PLK6 1076 aa22.85■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 F5H423 210 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 DNAJC6O75061 913 aa22.85■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ECEL1O95672 775 aa22.85■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 NDST3O95803 873 aa22.85■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 PNLIPP16233 465 aa22.85■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ACTR1BP42025 376 aa22.85■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ABCG1P45844 678 aa22.85■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ACTR1AP61163 376 aa22.85■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 NOMO1Q15155 1222 aa22.85■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 KDELC1Q6UW63 502 aa22.85■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 TMC3Q7Z5M5 1100 aa22.85■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 LSMEM2Q8N112 164 aa22.85■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 NAGSQ8N159 534 aa22.85■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ZNF567Q8N184 647 aa22.85■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 C10orf88Q9H8K7 445 aa22.85■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 KIF26BQ2KJY2 2108 aa22.84■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 BTNL10A8MVZ5 291 aa22.84■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 AURKAO14965 403 aa22.84■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ASMTLO95671 621 aa22.84■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 VAV2P52735 878 aa22.84■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 B4GALNT1Q00973 533 aa22.84■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.84■■□□□ 1.25
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