RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 SRGAP2O75044 1071 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 RASAL1O95294 804 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MOCS3O95396 460 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 NADKO95544 446 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 STSP08842 583 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PRPS2P11908 318 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CYP11B1P15538 503 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 G0S2P27469 103 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CCR1P32246 355 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 FMO5P49326 533 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GNG10P50151 68 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SERPINB9P50453 376 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 YARSP54577 528 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CDH4P55283 916 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 RACK1P63244 317 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MAPK7Q13164 816 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GALEQ14376 348 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SLC18A3Q16572 532 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 DNAL1Q4LDG9 190 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 YIF1BQ5BJH7 314 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM65Q6PI78 240 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CYFIP1Q7L576 1253 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TAC4Q86UU9 113 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GPR180Q86V85 440 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 KLHL7Q8IXQ5 586 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 UBL4BQ8N7F7 174 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MCPH1Q8NEM0 835 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 DTX3LQ8TDB6 740 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GATAD2BQ8WXI9 593 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ASB12Q8WXK4 309 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 C9orf72Q96LT7 481 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 FOPNLQ96NB1 174 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 FIZ1Q96SL8 496 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PSMB7Q99436 277 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 NEU1Q99519 415 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CBWD1Q9BRT8 395 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TGIF2Q9GZN2 237 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MLXIPQ9HAP2 919 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SLC39A10Q9ULF5 831 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SLC22A14Q9Y267 594 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TRAF6Q9Y4K3 522 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ACTL7AQ9Y615 435 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 WASF2Q9Y6W5 498 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM82A0PJX8 343 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 DENND3A2RUS2 1198 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TISP43B9A030 160 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 USP12O75317 370 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ENDOD1O94919 500 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 OPN1LWP04000 364 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PRKCBP05771 671 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GNAO1P09471 354 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MLNP12872 115 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ITIH2P19823 946 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 HMGCLP35914 325 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ACTR1BP42025 376 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PAFAH1B1P43034 410 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CARSP49589 748 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CASP6P55212 293 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ACTR2P61160 394 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ERVK-8P63133 956 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CNTN2Q02246 1040 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PEX6Q13608 980 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 BMPR2Q13873 1038 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 DSG2Q14126 1118 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ODF1Q14990 250 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SSX2Q16385 188 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ALG11Q2TAA5 492 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ATG16L1Q676U5 607 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 UGT3A1Q6NUS8 523 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PKN3Q6P5Z2 889 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 RFWD3Q6PCD5 774 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 IGFN1Q86VF2 1251 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CREG2Q8IUH2 290 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 C4orf33Q8N1A6 199 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 Q8NFD4 153 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SLC13A3Q8WWT9 602 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SEC14L1Q92503 715 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MCRS1Q96EZ8 462 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MAGED4Q96JG8 741 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PPM1MQ96MI6 270 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF285Q96NJ3 590 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms