RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 EGFL7Q9UHF1 273 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 ZNF112Q9UJU3 913 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 FAM72CH0Y354 149 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 I6L893 689 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 TULP3O75386 442 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 BMP4P12644 408 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 CPB1P15086 417 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 GRK3P35626 688 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 PHC1P78364 1004 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 RCAN2Q14206 197 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 CYP51A1Q16850 503 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 FAM72AQ5TYM5 149 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 IQSEC1Q6DN90 963 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 FAM72DQ6L9T8 149 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 FAM72BQ86X60 149 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 CHST13Q8NET6 341 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 HPS1Q92902 700 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 TP53INP1Q96A56 240 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 ALG2Q9H553 416 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 CDHR5Q9HBB8 845 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 FZD1Q9UP38 647 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 GPR45Q9Y5Y3 372 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 NR5A2O00482 541 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 NUAK1O60285 661 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 GPC4O75487 556 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 NPPAP01160 153 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 ALBP02768 609 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 THRBP10828 461 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 ERCC2P18074 760 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 NFKBIAP25963 317 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 OCA2Q04671 838 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 BFSP2Q13515 415 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 CAMK2BQ13554 666 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 ACOX1Q15067 660 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 PLCL1Q15111 1095 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 FAM83EQ2M2I3 478 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 AGAP9Q5VTM2 703 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 CRTC3Q6UUV7 619 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 PRR23BQ6ZRT6 265 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 FAM35AQ86V20 835 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 CLYBLQ8N0X4 340 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 SCML4Q8N228 414 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 KCTD13Q8WZ19 329 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 BDH2Q9BUT1 245 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 NEU3Q9UQ49 428 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 ST14Q9Y5Y6 855 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 A0A1W2PP18 115 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 ISPDA4D126 451 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 C16orf96A6NNT2 1141 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 M0QX08 132 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 C22orf31O95567 290 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 GJB1P08034 283 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 CLCN5P51795 746 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 RAD23AP54725 363 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 EPS8Q12929 822 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 C6orf141Q5SZD1 244 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 BIRC7Q96CA5 298 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 TBL1YQ9BQ87 522 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 BRINP2Q9C0B6 783 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 TTC34A8MYJ7 566 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 WNT10BO00744 389 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 LCP1P13796 627 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 TCF3P15923 654 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 TPH1P17752 444 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 BMPR1AP36894 532 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 SLC26A2P50443 739 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 HERVK_113P63132 956 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 EMX2Q04743 252 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 GEN1Q17RS7 908 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 VPS26BQ4G0F5 336 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 DSG4Q86SJ6 1040 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 SPATA6LQ8N4H0 392 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 KIAA1958Q8N8K9 716 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 SGCDQ92629 289 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 WNT8BQ93098 351 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 C8orf37Q96NL8 207 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 FCRL5Q96RD9 977 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms