RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-208ENST00000481518 NRROSQ86YC3 692 aa22.94■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 KRT35Q92764 455 aa22.94■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 TADA1Q96BN2 335 aa22.94■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 DCBLD2Q96PD2 775 aa22.94■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 TRIB3Q96RU7 358 aa22.94■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 WDR24Q96S15 920 aa22.94■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.94■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 SUFUQ9UMX1 484 aa22.94■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa22.94■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa22.94■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 B4DGG1 531 aa22.93■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 ANKRD66B4E2M5 251 aa22.93■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 NDUFA10O95299 355 aa22.93■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 GNPDA1P46926 289 aa22.93■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 DOK6Q6PKX4 331 aa22.93■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 KATNAL2Q8IYT4 538 aa22.93■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 GPBAR1Q8TDU6 330 aa22.93■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa22.93■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa22.93■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 DNPEPQ9ULA0 475 aa22.93■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa22.93■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa22.92■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa22.92■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 NR2C2P49116 596 aa22.92■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 GABREP78334 506 aa22.92■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 TFDP2Q14188 446 aa22.92■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 TBC1D25Q3MII6 688 aa22.92■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 RAD9BQ6WBX8 426 aa22.92■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 KDELC2Q7Z4H8 507 aa22.92■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 NT5DC3Q86UY8 548 aa22.92■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 NLRP8Q86W28 1048 aa22.92■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 NRSN1Q8IZ57 195 aa22.92■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 SPATA22Q8NHS9 363 aa22.92■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 SLC25A51Q9H1U9 297 aa22.92■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 DPEP2Q9H4A9 486 aa22.92■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 DSPP15924 2871 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 A0A1W2PQM1 296 aa22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 PMS2P1A4D2B8 440 aa22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 INPP4BO15327 924 aa22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 TCEA3O75764 348 aa22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 IVLP07476 585 aa22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 PTPN3P26045 913 aa22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 AK4P27144 223 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 SPINT3P49223 89 aa22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 CCL7P80098 99 aa22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 WASHC5Q12768 1159 aa22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 PCSK7Q16549 785 aa22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 C14orf28Q4W4Y0 310 aa22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 TFDP3Q5H9I0 405 aa22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 CERCAMQ5T4B2 595 aa22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 HAUS1Q96CS2 278 aa22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 EID2BQ96D98 161 aa22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 CRELD1Q96HD1 420 aa22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 COX14Q96I36 57 aa22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 ADGRE3Q9BY15 652 aa22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 GLOD4Q9HC38 313 aa22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.91■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 PIRTP0C851 137 aa22.9■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 SPIDRQ14159 915 aa22.9■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.261e-8■■■■□ 19.6
PSME4-208ENST00000481518 TEX44Q53QW1 395 aa22.9■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 DAAM2Q86T65 1068 aa22.9■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 TMTC1Q8IUR5 882 aa22.9■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 WDR48Q8TAF3 677 aa22.9■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 HIC2Q96JB3 615 aa22.9■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa22.9■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 TAAR2Q9P1P5 351 aa22.9■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 SATB2Q9UPW6 733 aa22.9■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 RNF215Q9Y6U7 377 aa22.9■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 URB1O60287 2271 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PSME4-208ENST00000481518 FADS2P1A8MWK0 482 aa22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 FGF1P05230 155 aa22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 GLB1P16278 677 aa22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ITPKBP27987 946 aa22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 CD68P34810 354 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ADCY8P40145 1251 aa22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 LSSP48449 732 aa22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 MAZP56270 477 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 CTBSQ01459 385 aa22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 C3orf38Q5JPI3 329 aa22.89■■□□□ 1.25
PSME4-208ENST00000481518 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms