RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 TEKT5Q96M29 485 aa30.63■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 HERPUD2Q9BSE4 406 aa30.63■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 LGR4Q9BXB1 951 aa30.63■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 OSBPL8Q9BZF1 889 aa30.63■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 CLPBQ9H078 707 aa30.63■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 FGF22Q9HCT0 170 aa30.63■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 EVA1BQ9NVM1 165 aa30.63■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 HACD1B0YJ81 288 aa30.62■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 TPP1O14773 563 aa30.62■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 CKMT1AP12532 417 aa30.62■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 STC1P52823 247 aa30.62■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 WASHC5Q12768 1159 aa30.62■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 ELOCQ15369 112 aa30.62■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 KCTD16Q68DU8 428 aa30.62■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 KDELC2Q7Z4H8 507 aa30.62■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 SPATA22Q8NHS9 363 aa30.62■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 LYSMD1Q96S90 227 aa30.62■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 DOLKQ9UPQ8 538 aa30.62■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 FAM149AA5PLN7 773 aa30.61■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 ANKRD66B4E2M5 251 aa30.61■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 LMO7DNF2Z398 122 aa30.61■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 CLDN7O95471 211 aa30.61■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 TNFP01375 233 aa30.61■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 PTPN7P35236 360 aa30.61■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 CETN2P41208 172 aa30.61■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 CLDN6P56747 220 aa30.61■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 SLC14A2Q15849 920 aa30.61■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 MARCH9Q86YJ5 346 aa30.61■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 AP2M1Q96CW1 435 aa30.61■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 TRIB3Q96RU7 358 aa30.61■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 ABCG8Q9H221 673 aa30.61■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 USP29Q9HBJ7 922 aa30.61■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 MOSPD1Q9UJG1 213 aa30.61■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 EFR3BQ9Y2G0 817 aa30.61■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa30.6■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa30.6■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 H7C0C1 242 aa30.6■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 FTCDO95954 541 aa30.6■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 ATP5OP48047 213 aa30.6■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 NOMO1Q15155 1222 aa30.6■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 AADACL2Q6P093 401 aa30.6■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 HTR3CQ8WXA8 447 aa30.6■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 TADA1Q96BN2 335 aa30.6■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 TEX101Q9BY14 249 aa30.6■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 ADGRG1Q9Y653 693 aa30.6■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 DGKBQ9Y6T7 804 aa30.6■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 U3KQA8 63 aa30.6■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa30.59■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 TNFRSF10CO14798 259 aa30.59■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 YY2O15391 372 aa30.59■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 PROS1P07225 676 aa30.59■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 PYGMP11217 842 aa30.59■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 NFKB1P19838 968 aa30.59■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 TEAD1P28347 426 aa30.59■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 CD68P34810 354 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 GPR1P46091 355 aa30.59■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 CDK3Q00526 305 aa30.59■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 CDK18Q07002 472 aa30.59■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 DPTQ07507 201 aa30.59■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 XRCC4Q13426 336 aa30.59■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 TMPRSS12Q86WS5 348 aa30.59■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 UBL4BQ8N7F7 174 aa30.59■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 ACTL9Q8TC94 416 aa30.59■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 SCAMP4Q969E2 229 aa30.59■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 UBP1Q9NZI7 540 aa30.59■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa30.59■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 AKAP13Q12802 2813 aa30.59■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 PMPCBO75439 489 aa30.58■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa30.58■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 HES3Q5TGS1 186 aa30.58■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 ZNF765Q7L2R6 523 aa30.58■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 NRSN1Q8IZ57 195 aa30.58■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 ZNF567Q8N184 647 aa30.58■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 VAT1Q99536 393 aa30.58■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 C10orf88Q9H8K7 445 aa30.58■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 CYP4F12Q9HCS2 524 aa30.58■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa30.58■■■□□ 2.49
INO80B-201ENST00000233331 PRSS38A1L453 326 aa30.57■■■□□ 2.48
INO80B-201ENST00000233331 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
INO80B-201ENST00000233331 F5H423 210 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
INO80B-201ENST00000233331 ARHGAP6O43182 974 aa30.57■■■□□ 2.48
INO80B-201ENST00000233331 NR0B2Q15466 257 aa30.57■■■□□ 2.48
INO80B-201ENST00000233331 CDKN3Q16667 212 aa30.57■■■□□ 2.48
INO80B-201ENST00000233331 PID1Q7Z2X4 250 aa30.57■■■□□ 2.48
INO80B-201ENST00000233331 GKN2Q86XP6 184 aa30.57■■■□□ 2.48
INO80B-201ENST00000233331 CCDC112Q8NEF3 446 aa30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.4 ms