RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031145.6

Pdcl2-201, Transcript of Phosducin-like protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdcl2, Length 1,181 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Scrn3Q3TMH2 418 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Krt26Q3TRJ4 462 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 TceancQ3US16 359 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ppm1hQ3UYC0 513 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Prss53Q571E5 552 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fam189bQ5HZJ5 669 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zbtb17Q60821 794 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Itga7Q61738 1179 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Sf1Q64213 653 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ddx51Q6P9R1 639 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Unc93aQ710D3 458 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Glra2Q7TNC8 452 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Oog2Q7TPX8 476 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Nucks1Q80XU3 234 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Slitrk4Q810B8 837 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kiaa1671Q8BRV5 308 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Trerf1Q8BXJ2 1205 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Lrrc25Q8K1T1 297 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Nup85Q8R480 656 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Map3k21Q8VDG6 1002 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Vmn1r71Q8VIC0 307 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Atpaf2Q91YY4 289 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cybrd1Q925G2 290 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Trps1Q925H1 1281 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fam3aQ9D8T0 230 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Poc5Q9DBS8 558 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 IvdQ9JHI5 424 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 D7h11orf16Q9JJR6 402 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dpp6Q9Z218 804 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zfc3h1B2RT41 1992 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Notch4P31695 1964 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gtf3c1Q8K284 2101 aa7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 BptfA2A654 3036 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Znf536Q8K083 1302 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ighv11-1A0A075B5R6 117 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm7792A0A0J9YU01 481 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 A0A286YD13 301 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm3183D3YUJ6 481 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cdh19E9Q3A7 770 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zfp169E9Q3R6 731 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm10073E9Q3T0 114 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 E230025N22RikG5E8S3 482 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pabpc4lG5E8X2 370 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm3139J3QK78 481 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm3106J3QPH3 481 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Agpat1O35083 285 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Bhlhe40O35185 411 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ifnb1P01575 182 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ctla2bP12400 113 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ly6fP35460 134 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Klk1b26P36369 261 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rhox5P52651 210 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Smpdl3bP58242 456 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 SgcgP82348 291 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Nell1Q2VWQ2 810 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Q3TYS2 187 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm14685Q52KH6 695 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 PighQ5M9N4 188 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mns1Q61884 491 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Sin3bQ62141 1098 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 InavaQ7TN12 663 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Adcy2Q80TL1 1090 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Otop1Q80VM9 600 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rtp2Q80ZI2 223 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zfp438Q8BFX2 798 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Efl1Q8C0D5 1127 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Sh3rf3Q8C120 878 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gbp5Q8CFB4 590 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Plekho2Q8K124 495 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Irf2bp1Q8R3Y8 584 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rab7bQ8VEA8 199 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Erlec1Q8VEH8 483 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Camk1Q91YS8 374 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Q9CQC3 228 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Thap12Q9CUX1 758 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Creld2Q9CYA0 350 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cnot8Q9D8X5 292 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Abcb6Q9DC29 842 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Adam21Q9JI76 729 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Socs6Q9JLY0 533 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Il18bpQ9Z0M9 193 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Eif2s3yQ9Z0N2 472 aa7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Uso1Q9Z1Z0 959 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 PtprfA2A8L5 1898 aa7.89□□□□□ -1.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cacna1bO55017 2327 aa7.89□□□□□ -1.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm3604A0A087WPN2 559 aa7.89□□□□□ -1.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Igkv17-127A0A0G2JDN5 117 aa7.89□□□□□ -1.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ttc39aA2ACP1 578 aa7.89□□□□□ -1.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Syndig1A2ANU3 258 aa7.89□□□□□ -1.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Armt1A6H630 439 aa7.89□□□□□ -1.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm3373A6NAS7 205 aa7.89□□□□□ -1.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm15821A6X8J8 139 aa7.89□□□□□ -1.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm9507D3Z5T3 223 aa7.89□□□□□ -1.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Vmn2r34E9PVI0 852 aa7.89□□□□□ -1.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kif6E9PX57 802 aa7.89□□□□□ -1.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 ErmardE9Q048 622 aa7.89□□□□□ -1.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zscan4bE9Q3G0 505 aa7.89□□□□□ -1.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zbtb10E9Q8X5 861 aa7.89□□□□□ -1.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm3127E9Q9P5 263 aa7.89□□□□□ -1.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 5830473C10RikF8VQ07 620 aa7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 62.6 ms