RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550078.2

ZBED6-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED6, Length 12,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6-202ENST00000550078 SLC6A3Q01959 620 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP5.25□□□□□ -1.572e-6■□□□□ 10.5
ZBED6-202ENST00000550078 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 SLX4IPQ5VYV7 408 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 KCNV1Q6PIU1 500 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 HHLA1C9JL84 531 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 OR56A5P0C7T3 313 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 ALDH3A2P51648 485 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 ARSEP51690 589 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 EPHA4P54764 986 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 CSHL1Q14406 222 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 MBTPS1Q14703 1052 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 OASLQ15646 514 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 NDUFA9Q16795 377 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP5.25□□□□□ -1.572e-7■□□□□ 8.8
ZBED6-202ENST00000550078 CEP97Q8IW35 865 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 SOCS4Q8WXH5 440 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 FAM96BQ9Y3D0 163 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 GRIN2DO15399 1336 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 C12orf56Q8IXR9 622 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 VWA5B2Q8N398 1253 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 OR2T27Q8NH04 317 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 ARHGEF10O15013 1369 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 ABCC8Q09428 1581 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 ADAMTS3O15072 1205 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 TPST2O60704 377 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 MT-ND5P03915 603 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 HEXAP06865 529 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 CCL5P13501 91 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 NMT1P30419 496 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 SFNP31947 248 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 C20orf194Q5TEA3 1177 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 CES3Q6UWW8 571 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 ERO1BQ86YB8 467 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 TC2NQ8N9U0 490 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 RCOR1Q9UKL0 485 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 NPTNQ9Y639 398 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 CLIC4Q9Y696 253 aa5.25□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 ZBTB14O43829 449 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 ALBP02768 609 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 ALPPP05187 535 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 RAB4AP20338 218 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 CD72P21854 359 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 KELP23276 732 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 CCT8P50990 548 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 ATP1A4Q13733 1029 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 OR13C3Q8NGS6 347 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 LCN9Q8WX39 176 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 HMG20AQ9NP66 347 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 SAR1BQ9Y6B6 198 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 FFAR3O14843 346 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 GPR42O15529 346 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 SAGP10523 405 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 CHN2P52757 468 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 TRAF2Q12933 501 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 VPS26BQ4G0F5 336 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 ALG10BQ5I7T1 473 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 C9orf64Q5T6V5 341 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 ARMC12Q5T9G4 340 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 CEP295NLQ96MC4 621 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 DHRS9Q9BPW9 319 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 DCLK3Q9C098 648 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 OSBPL3Q9H4L5 887 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 TMBIM4Q9HC24 238 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 PCDHGC3Q9UN70 934 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 LRRN3E7EW58 273 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 MFSD11O43934 449 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 SEMA3BQ13214 749 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 XKR3Q5GH77 459 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 SHC3Q92529 594 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 METTL9Q9H1A3 318 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 TDP1Q9NUW8 608 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 OGDHLQ9ULD0 1010 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 SFTPBP07988 381 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 MYL12AP19105 171 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 HSD11B1P28845 292 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 PIK3CGP48736 1102 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 MBTD1Q05BQ5 628 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED6-202ENST00000550078 TSNQ15631 228 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms