RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557021.5

UBE2V1-222, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 V1, human

TSL 5 BASIC

Gene UBE2V1, Length 2,258 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2V1-222	ENST00000557021	MMP12	P39900	470 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	PLTP	P55058	493 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	PTS	Q03393	145 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZBTB16	Q05516	673 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	TCF15	Q12870	199 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	RALGDS	Q12967	914 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	CNGA3	Q16281	694 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	ALS2CL	Q60I27	953 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	ERAP2	Q6P179	960 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	LONP2	Q86WA8	852 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	SLCO2A1	Q92959	643 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	SCAMP4	Q969E2	229 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	BIRC7	Q96CA5	298 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	FEM1C	Q96JP0	617 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	FBRS	Q9HAH7	460 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZNF217	O75362	1048 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	C6	P13671	934 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	MGAT1	P26572	445 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	CLDN2	P57739	230 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	ACOX1	Q15067	660 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	MSS51	Q4VC12	460 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021		Q6ZVL8	140 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	USP45	Q70EL2	814 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	CEP68	Q76N32	757 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	DKK3	Q9UBP4	350 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	RAD51B	O15315	384 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	CA4	P22748	312 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	TUBB2A	Q13885	445 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	CASC4	Q6P4E1	433 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	LIPI	Q6XZB0	460 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	USP30	Q70CQ3	517 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	SERPINB12	Q96P63	405 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	IER2	Q9BTL4	223 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	CAPN8	A6NHC0	703 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021		K7ESM1	405 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	IGHV4-34	P06331	123 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	ITPKA	P23677	461 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	GRIA4	P48058	902 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	ARHGEF7	Q14155	803 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	TCEA2	Q15560	299 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	DUPD1	Q68J44	220 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	LRRC45	Q96CN5	670 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	SNF8	Q96H20	258 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	SPACA7	Q96KW9	195 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	SYBU	Q9NX95	663 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	FZD4	Q9ULV1	537 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	SCML1	Q9UN30	329 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	TSPAN11	A1L157	253 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	GM2A	P17900	193 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	CCDC25	Q86WR0	208 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZNF711	Q9Y462	761 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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