RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259216.4

CFC1-201, Transcript of cripto, FRL-1, cryptic family 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFC1, Length 1,046 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1-201ENST00000259216 E2F1Q01094 437 aa20.3■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 PPARDQ03181 441 aa20.3■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 CYP4F3Q08477 520 aa20.3■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 LRRC38Q5VT99 294 aa20.3■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 VSIG1Q86XK7 387 aa20.3■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 MAP7D3Q8IWC1 876 aa20.3■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 RHOT2Q8IXI1 618 aa20.3■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 SLC35F3Q8IY50 421 aa20.3■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 BBS5Q8N3I7 341 aa20.3■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 HDAC11Q96DB2 347 aa20.3■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 SMIM14Q96QK8 99 aa20.3■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 FGF22Q9HCT0 170 aa20.3■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 PHTF1Q9UMS5 762 aa20.3■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 TMEM202A6NGA9 273 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 YY2O15391 372 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 PRLP01236 227 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 VIPR1P32241 457 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 HNF1BP35680 557 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 KIAA1024LP59773 190 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 DSC2Q02487 901 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 NIPAL4Q0D2K0 466 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 SLC9A4Q6AI14 798 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 GUSBP11Q6P575 273 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 TSPAN33Q86UF1 283 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 NSMCE1Q8WV22 266 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 OR1E3Q8WZA6 343 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 SCRN2Q96FV2 425 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 PDXPQ96GD0 296 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 WDR92Q96MX6 357 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 LGR4Q9BXB1 951 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 SLC13A1Q9BZW2 595 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 AMACRQ9UHK6 382 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 RAI2Q9Y5P3 530 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 DGKBQ9Y6T7 804 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 FAM208BQ5VWN6 2430 aa20.29■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 RP1P56715 2156 aa20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 ITPR1Q14643 2758 aa20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 A0A0U1RQS6 177 aa20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 LCA5LO95447 670 aa20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 HLA-DQB2P05538 268 aa20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 HADHBP55084 474 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 SRP54P61011 504 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 RTP5Q14D33 572 aa20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 TAZQ16635 292 aa20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 FAXCQ5TGI0 409 aa20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 PNCKQ6P2M8 343 aa20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 HID1Q8IV36 788 aa20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 CNTD1Q8N815 330 aa20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 DTD2Q96FN9 168 aa20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 OLFM3Q96PB7 478 aa20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 CLCA2Q9UQC9 943 aa20.28■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 URB1O60287 2271 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 LRRD1A4D1F6 860 aa20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 RASGRP1O95267 797 aa20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 MT-CO3P00414 261 aa20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 CCNB1P14635 433 aa20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 BLKP51451 505 aa20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 ACOX1Q15067 660 aa20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 CDKN3Q16667 212 aa20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 HS1BP3Q53T59 392 aa20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 ARMC12Q5T9G4 340 aa20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 ENPP7Q6UWV6 458 aa20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 RFLNAQ6ZTI6 216 aa20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 IFI44Q8TCB0 444 aa20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 LGMNQ99538 433 aa20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 IL12RB2Q99665 862 aa20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 TRIM5Q9C035 493 aa20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 NRSN2Q9GZP1 204 aa20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 RAXQ9Y2V3 346 aa20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.27■□□□□ 0.84
CFC1-201ENST00000259216 PSMD11O00231 422 aa20.26■□□□□ 0.83
CFC1-201ENST00000259216 CASC3O15234 703 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CFC1-201ENST00000259216 MMP2P08253 660 aa20.26■□□□□ 0.83
CFC1-201ENST00000259216 ALPIP09923 528 aa20.26■□□□□ 0.83
CFC1-201ENST00000259216 CTPS1P17812 591 aa20.26■□□□□ 0.83
CFC1-201ENST00000259216 MX2P20592 715 aa20.26■□□□□ 0.83
CFC1-201ENST00000259216 FECHP22830 423 aa20.26■□□□□ 0.83
CFC1-201ENST00000259216 HTR1BP28222 390 aa20.26■□□□□ 0.83
CFC1-201ENST00000259216 ETV3P41162 512 aa20.26■□□□□ 0.83
CFC1-201ENST00000259216 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CFC1-201ENST00000259216 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CFC1-201ENST00000259216 ZBTB17Q13105 803 aa20.26■□□□□ 0.83
CFC1-201ENST00000259216 PERM1Q5SV97 790 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms