RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PAG1Q9NWQ8 432 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAU2Q9Y6X3 613 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UTYO14607 1347 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A4D1N5 150 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LINC00473A8K010 186 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM157AC9JC47 383 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPC4O75487 556 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GCATO75600 419 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PENKP01210 267 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TACR2P21452 398 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACRV1P26436 265 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRKCIP41743 596 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLCN5P51795 746 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CYP4F2P78329 520 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RALGDSQ12967 914 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNC3Q14003 757 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GALNT3Q14435 633 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DLG2Q15700 870 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HYAL4Q2M3T9 481 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLK5Q496M5 336 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRIF1Q5T3J3 769 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C6orf163Q5TEZ5 329 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM198Q66K66 360 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBXO42Q6P3S6 717 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VSTM1Q6UX27 236 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC25Q86WR0 208 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DPP10Q8N608 796 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHST13Q8NET6 341 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR52N4Q8NGI2 321 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM170AQ8WVE7 144 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRT35Q92764 455 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EDAQ92838 391 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PTP4A1Q93096 173 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDRT15Q96T59 188 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AGAP2Q99490 1192 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACAT2Q9BWD1 397 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC28A3Q9HAS3 691 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BPIFA1Q9NP55 256 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC8A2Q9UPR5 921 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BTBD3Q9Y2F9 522 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ABCC9O60706 1549 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A1B0GVM2 712 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A1W2PR77 199 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NFATC1O95644 943 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PTMAP06454 111 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHRNA5P30532 468 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HOXC8P31273 242 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TXKP42681 527 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCT8P50990 548 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ALDH3A2P51648 485 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC25A3Q00325 362 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ECT2LQ008S8 904 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TFAP4Q01664 338 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC18A2Q05940 514 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PTK6Q13882 451 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDONQ4KMG0 1287 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBC1D9BQ66K14 1250 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIAA0895LQ68EN5 471 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CES5AQ6NT32 575 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 QSOX2Q6ZRP7 698 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NOXA1Q86UR1 476 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HAPLN4Q86UW8 402 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IQCHQ86VS3 1027 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARHGEF19Q8IW93 802 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SCYL3Q8IZE3 742 aa5.05□□□□□ -1.6
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