RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278833.3

ROM1-201, Transcript of retinal outer segment membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ROM1, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1-201ENST00000278833 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 PPM1LQ5SGD2 360 aa25.22■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 KLC3Q6P597 504 aa25.22■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 HASPINQ8TF76 798 aa25.22■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 RCN3Q96D15 328 aa25.22■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa25.22■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 MEAF6Q9HAF1 191 aa25.22■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 AP1G1O43747 822 aa25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 JUNP05412 331 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 MMP2P08253 660 aa25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 CST5P28325 142 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 ACVR1Q04771 509 aa25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 MAPRE2Q15555 327 aa25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 CNSTQ6PJW8 725 aa25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 NUP93Q8N1F7 819 aa25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 CATSPER1Q8NEC5 780 aa25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 CATSPER2Q96P56 530 aa25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 YIPF3Q9GZM5 350 aa25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 TRPC7Q9HCX4 862 aa25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 IPO13O94829 963 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 THOP1P52888 689 aa25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 NFKB2Q00653 900 aa25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 SEPT6Q14141 434 aa25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 OR13J1Q8NGT2 312 aa25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 OLFM1Q99784 485 aa25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 MPP6Q9NZW5 540 aa25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 SARDHQ9UL12 918 aa25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 OGDHLQ9ULD0 1010 aa25.21■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 TCAF2A6NFQ2 919 aa25.2■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 A8MT66 165 aa25.2■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 ERFP50548 548 aa25.2■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 TBX4P57082 545 aa25.2■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 MED21Q13503 144 aa25.2■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 LAMB3Q13751 1172 aa25.2■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 CILP2Q8IUL8 1156 aa25.2■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 KLHDC9Q8NEP7 349 aa25.2■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 WDR41Q9HAD4 459 aa25.2■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 RIMKLBQ9ULI2 386 aa25.2■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa25.2■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 ME2P23368 584 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 PGGT1BP53609 377 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 SQLEQ14534 574 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 TRIP10Q15642 601 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 MARC1Q5VT66 337 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 LPCAT4Q643R3 524 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 CCNYL1Q8N7R7 359 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 TOP1MTQ969P6 601 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 L3HYPDHQ96EM0 354 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 MOCOSQ96EN8 888 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 HMCESQ96FZ2 354 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 EOMESO95936 686 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 EN2P19622 333 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 ATP4BP51164 291 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 AQP4P55087 323 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 MTA1Q13330 715 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 SLC39A12Q504Y0 691 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 MS4A13Q5J8X5 152 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 HECTD2Q5U5R9 776 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 TICAM1Q8IUC6 712 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 CDRT15Q96T59 188 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 TSC22D3Q99576 134 aa25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa25.18■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 DRGXA6NNA5 263 aa25.18■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 AURKAO14965 403 aa25.18■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 IL10RBQ08334 325 aa25.18■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 CEACAM7Q14002 265 aa25.18■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 ADGRE1Q14246 886 aa25.18■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 FLOT2Q14254 428 aa25.18■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 PTK2BQ14289 1009 aa25.18■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 CSHL1Q14406 222 aa25.18■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 TMEM198Q66K66 360 aa25.18■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 RGS18Q9NS28 235 aa25.18■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 RIMS3Q9UJD0 308 aa25.18■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 DENRO43583 198 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 IGLV3-27P01718 113 aa25.17■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 CD1EP15812 388 aa25.17■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 VCLP18206 1134 aa25.17■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 FOXB2Q5VYV0 432 aa25.17■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 NXNQ6DKJ4 435 aa25.17■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 FAM45BPQ6NSW5 357 aa25.17■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 PHC3Q8NDX5 983 aa25.17■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 GPR150Q8NGU9 434 aa25.17■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 ARRDC2Q8TBH0 407 aa25.17■■□□□ 1.62
ROM1-201ENST00000278833 FAM45AQ8TCE6 357 aa25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms