RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641145.1

NFIC-211, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

BASIC

Gene NFIC, Length 8,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-211ENST00000641145 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 TMCO3Q6UWJ1 677 aa19.03■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 FERMT1Q9BQL6 677 aa19.03■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 CRACR2AQ9BSW2 395 aa19.02■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 EIF5P55010 431 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 IFFO1Q0D2I5 559 aa19.02■□□□□ 0.64
NFIC-211ENST00000641145 CEP57L1Q8IYX8 460 aa19.01■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 ME1P48163 572 aa19.01■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 RIPK4P57078 832 aa19.01■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 DAAM2Q86T65 1068 aa19.01■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 MBD3O95983 291 aa19.01■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 SLU7O95391 586 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 NUP133Q8WUM0 1156 aa19■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 DDX11Q96FC9 970 aa19■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 CRBNQ96SW2 442 aa19■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 CCDC192P0DO97 292 aa19■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 TMCO5BA8MYB1 307 aa18.99■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 MAP9Q49MG5 647 aa18.99■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 TTC16Q8NEE8 873 aa18.99■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 TNMDQ9H2S6 317 aa18.99■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 VPS36Q86VN1 386 aa18.99■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 SERPINA10Q9UK55 444 aa18.99■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 MACROD2A1Z1Q3 448 aa18.98■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 USP5P45974 858 aa18.98■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP18.98■□□□□ 0.639e-10■■■■■ 60.1
NFIC-211ENST00000641145 V9GYY5 206 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 C6orf163Q5TEZ5 329 aa18.98■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 C22orf23Q9BZE7 217 aa18.98■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 PIBF1Q8WXW3 757 aa18.98■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 LRRC45Q96CN5 670 aa18.98■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 CCDC178Q5BJE1 867 aa18.98■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 TAOK3Q9H2K8 898 aa18.98■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 MRE11P49959 708 aa18.97■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 ANKRD1Q15327 319 aa18.97■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 NLRP2Q9NX02 1062 aa18.97■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 MCM2P49736 904 aa18.97■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 TMOD2Q9NZR1 351 aa18.97■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 CDKL5O76039 1030 aa18.96■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 LNPKQ9C0E8 428 aa18.96■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 SPA17Q15506 151 aa18.96■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 LRSAM1Q6UWE0 723 aa18.96■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.96■□□□□ 0.63
NFIC-211ENST00000641145 ERICH4A6NGS2 130 aa18.96■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 FIBPO43427 364 aa18.95■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 MCM3P25205 808 aa18.95■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 LMAN1P49257 510 aa18.95■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 CDC45O75419 566 aa18.95■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 LUZP1Q86V48 1076 aa18.94■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa18.94■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa18.94■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 MPHOSPH8Q99549 860 aa18.94■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 MICALCLQ6ZW33 695 aa18.94■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa18.94■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 FSD2A1L4K1 749 aa18.93■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 TSG101Q99816 390 aa18.93■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 GBP3Q9H0R5 595 aa18.93■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 RRP1P56182 461 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 PANK3Q9H999 370 aa18.92■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 WDR78Q5VTH9 848 aa18.92■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 VGFO15240 615 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 MAP3K9P80192 1104 aa18.92■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 UBAC1Q9BSL1 405 aa18.92■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 GNAI1P63096 354 aa18.91■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 AEBP1Q8IUX7 1158 aa18.91■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 CEP131Q9UPN4 1083 aa18.91■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 SH3BP5O60239 455 aa18.91■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 IKBKGQ9Y6K9 419 aa18.91■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 TDO2P48775 406 aa18.91■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa18.91■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 RBM10P98175 930 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 ZNF354CQ86Y25 554 aa18.91■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 STK3Q13188 491 aa18.9■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 ZMYND15Q9H091 742 aa18.9■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 ZNF287Q9HBT7 754 aa18.9■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 SMTNL1A8MU46 457 aa18.89■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 FKBP15Q5T1M5 1219 aa18.89■□□□□ 0.62
NFIC-211ENST00000641145 CCDC30Q5VVM6 783 aa18.89■□□□□ 0.61
NFIC-211ENST00000641145 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
NFIC-211ENST00000641145 ODF2LQ9ULJ1 636 aa18.89■□□□□ 0.61
NFIC-211ENST00000641145 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.89■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 38.5
NFIC-211ENST00000641145 UBA5Q9GZZ9 404 aa18.88■□□□□ 0.61
NFIC-211ENST00000641145 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
NFIC-211ENST00000641145 SURF6O75683 361 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
NFIC-211ENST00000641145 SPECC1Q5M775 1068 aa18.88■□□□□ 0.61
NFIC-211ENST00000641145 CEP135Q66GS9 1140 aa18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms