RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594708.1

SMC5-AS1-201, Transcript of SMC5 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC5-AS1, Length 1,818 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.47■■□□□ 1.83
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ANP32CO43423 234 aa26.47■■□□□ 1.83
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HOXC9P31274 260 aa26.47■■□□□ 1.83
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MTHFSP49914 203 aa26.47■■□□□ 1.83
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IP6K1Q92551 441 aa26.47■■□□□ 1.83
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BTG4Q9NY30 223 aa26.47■■□□□ 1.83
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.45■■□□□ 1.82
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SLIT2O94813 1529 aa26.45■■□□□ 1.82
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 FLT4P35916 1363 aa26.44■■□□□ 1.82
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.37■■□□□ 1.81
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.33■■□□□ 1.8
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 NBPF4Q96M43 638 aa26.28■■□□□ 1.8
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 CRB1P82279 1406 aa26.27■■□□□ 1.8
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.25■■□□□ 1.79
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.25■■□□□ 1.79
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.24■■□□□ 1.79
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.22■■□□□ 1.79
SMC5-AS1-201ENST00000594708 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GLI3P10071 1580 aa26.2■■□□□ 1.79
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MRS2Q9HD23 443 aa26.2■■□□□ 1.78
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.2■■□□□ 1.78
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.19■■□□□ 1.78
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NUDCQ9Y266 331 aa26.18■■□□□ 1.78
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.18■■□□□ 1.78
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.16■■□□□ 1.78
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NCAPD2Q15021 1401 aa26.16■■□□□ 1.78
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.78
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RXRBP28702 533 aa26.13■■□□□ 1.77
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.12■■□□□ 1.77
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCER2I3L3R5 266 aa26.11■■□□□ 1.77
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MEGF6O75095 1541 aa26.11■■□□□ 1.77
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IL2RBP14784 551 aa26.11■■□□□ 1.77
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.77
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DISP2A7MBM2 1401 aa26.1■■□□□ 1.77
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.09■■□□□ 1.77
SMC5-AS1-201ENST00000594708 A0A0G2JS52 829 aa26.08■■□□□ 1.77
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MYT1Q01538 1121 aa26.08■■□□□ 1.77
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.08■■□□□ 1.77
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.07■■□□□ 1.76
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
SMC5-AS1-201ENST00000594708 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.06■■□□□ 1.76
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.05■■□□□ 1.76
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