RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.1■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM27P14373 513 aa21.1■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.1■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 USP6P35125 1406 aa21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIF16BQ96L93 1317 aa21.09■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACEP12821 1306 aa21.08■□□□□ 0.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.08■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TBX22Q9Y458 520 aa21.08■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SSH2Q76I76 1423 aa21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IFT57Q9NWB7 429 aa21.06■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PEAK1Q9H792 1746 aa21.05■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF853P0CG23 659 aa21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GNAI1P63096 354 aa21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 USP31Q70CQ4 1352 aa21.04■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.03■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.02■□□□□ 0.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.01■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VAMP4O75379 141 aa21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM57Q8N5G2 664 aa21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CFAP44Q96MT7 982 aa20.99■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MBIPQ9NS73 344 aa20.99■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NBR1Q14596 966 aa20.98■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.98■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.98■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NUTM2FA1L443 756 aa20.97■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PIK3R4Q99570 1358 aa20.96■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 USP19O94966 1318 aa20.95■□□□□ 0.95
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PIK3C2AO00443 1686 aa20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 USP54Q70EL1 1684 aa20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANKARQ7Z5J8 1434 aa20.95■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TSPYL6Q8N831 410 aa20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.94■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SMC5Q8IY18 1101 aa20.93■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM83GA6ND36 823 aa20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARHGEF10O15013 1369 aa20.91■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa20.91■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.91■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SBNO1A3KN83 1393 aa20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SEC24BO95487 1268 aa20.9■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABCC4O15439 1325 aa20.89■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FLT4P35916 1363 aa20.89■□□□□ 0.94
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAP3K19Q56UN5 1328 aa20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 USP35Q9P2H5 1018 aa20.88■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DCTN1Q14203 1278 aa20.88■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KDRP35968 1356 aa20.86■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCNA6P17658 529 aa20.85■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHL1O00533 1208 aa20.85■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIF24Q5T7B8 1368 aa20.85■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIAA0232Q92628 1395 aa20.85■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC4A3P48751 1232 aa20.84■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NUCB1Q02818 461 aa20.83■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CRB1P82279 1406 aa20.82■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGSF1Q8N6C5 1336 aa20.82■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SOX12O15370 315 aa20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MCM10Q7L590 875 aa20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GCC1Q96CN9 775 aa20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.81■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LRRC37A3O60309 1634 aa20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AMPHP49418 695 aa20.78■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.78■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NLRP6P59044 892 aa20.78■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms