RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569439.5

RGL3-216, Transcript of ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 3, human

TSL 2

Gene RGL3, Length 973 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RGL3-216	ENST00000569439	GLI3	P10071	1580 aa		28.06	■■■□□ 2.08
RGL3-216	ENST00000569439	RGPD5	Q99666	1765 aa		28.06	■■■□□ 2.08
RGL3-216	ENST00000569439	ABCC6	O95255	1503 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RGL3-216	ENST00000569439	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
RGL3-216	ENST00000569439	FBLN1	P23142	703 aa		28.04	■■■□□ 2.08
RGL3-216	ENST00000569439	NSD2	O96028	1365 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RGL3-216	ENST00000569439	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RGL3-216	ENST00000569439	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
RGL3-216	ENST00000569439	RGS12	O14924	1447 aa		28.01	■■■□□ 2.07
RGL3-216	ENST00000569439	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		28	■■■□□ 2.07
RGL3-216	ENST00000569439	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
RGL3-216	ENST00000569439	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
RGL3-216	ENST00000569439	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RGL3-216	ENST00000569439	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RGL3-216	ENST00000569439	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
RGL3-216	ENST00000569439	AMPH	P49418	695 aa		27.97	■■■□□ 2.07
RGL3-216	ENST00000569439	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		27.96	■■■□□ 2.07
RGL3-216	ENST00000569439	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
RGL3-216	ENST00000569439	USP35	Q9P2H5	1018 aa		27.96	■■■□□ 2.07
RGL3-216	ENST00000569439	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439	CRB1	P82279	1406 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439	MORC1	Q86VD1	984 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439	IP6K1	Q92551	441 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439	RTL1	A6NKG5	1358 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439	PEAK1	Q9H792	1746 aa		27.93	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439		A0A0G2JS52	829 aa		27.93	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439	MYT1	Q01538	1121 aa		27.93	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		27.93	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439	HOXC9	P31274	260 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439	ERBB3	P21860	1342 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439	FLT4	P35916	1363 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
RGL3-216	ENST00000569439	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RGL3-216	ENST00000569439	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RGL3-216	ENST00000569439	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RGL3-216	ENST00000569439	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
RGL3-216	ENST00000569439	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RGL3-216	ENST00000569439	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RGL3-216	ENST00000569439	POLK	Q9UBT6	870 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RGL3-216	ENST00000569439	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RGL3-216	ENST00000569439	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RGL3-216	ENST00000569439	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RGL3-216	ENST00000569439	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
RGL3-216	ENST00000569439	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RGL3-216	ENST00000569439	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
RGL3-216	ENST00000569439	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RGL3-216	ENST00000569439	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
RGL3-216	ENST00000569439	INSR	P06213	1382 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RGL3-216	ENST00000569439	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
RGL3-216	ENST00000569439	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RGL3-216	ENST00000569439	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RGL3-216	ENST00000569439	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
RGL3-216	ENST00000569439	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
RGL3-216	ENST00000569439	SOCS7	O14512	581 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RGL3-216	ENST00000569439	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RGL3-216	ENST00000569439	LRRC37A3	O60309	1634 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RGL3-216	ENST00000569439	DISP2	A7MBM2	1401 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RGL3-216	ENST00000569439	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		27.72	■■■□□ 2.03
RGL3-216	ENST00000569439	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RGL3-216	ENST00000569439	NBPF4	Q96M43	638 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RGL3-216	ENST00000569439	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
RGL3-216	ENST00000569439	MTHFS	P49914	203 aa		27.69	■■■□□ 2.02
RGL3-216	ENST00000569439	PDE3B	Q13370	1112 aa		27.69	■■■□□ 2.02
RGL3-216	ENST00000569439	DDB1	Q16531	1140 aa		27.69	■■■□□ 2.02
RGL3-216	ENST00000569439	IL2RB	P14784	551 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RGL3-216	ENST00000569439	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
RGL3-216	ENST00000569439	EP400	Q96L91	3159 aa		27.66	■■■□□ 2.02
RGL3-216	ENST00000569439	FAM182B	Q5T319	152 aa		27.66	■■■□□ 2.02
RGL3-216	ENST00000569439	TNS2	Q63HR2	1409 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RGL3-216	ENST00000569439	MEGF6	O75095	1541 aa		27.63	■■■□□ 2.01
RGL3-216	ENST00000569439	EYA1	Q99502	592 aa		27.63	■■■□□ 2.01
RGL3-216	ENST00000569439	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RGL3-216	ENST00000569439	EXOC5	O00471	708 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RGL3-216	ENST00000569439	PPP2R1A	P30153	589 aa		27.61	■■■□□ 2.01
RGL3-216	ENST00000569439	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		27.61	■■■□□ 2.01
RGL3-216	ENST00000569439	NCAPD2	Q15021	1401 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RGL3-216	ENST00000569439	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	27.6	■■■□□ 2.01
RGL3-216	ENST00000569439	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		27.58	■■■□□ 2
RGL3-216	ENST00000569439	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
RGL3-216	ENST00000569439	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		27.57	■■■□□ 2
RGL3-216	ENST00000569439	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
RGL3-216	ENST00000569439	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		27.56	■■■□□ 2
RGL3-216	ENST00000569439	IL13	P35225	146 aa		27.56	■■■□□ 2
RGL3-216	ENST00000569439	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
RGL3-216	ENST00000569439	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		27.55	■■■□□ 2
RGL3-216	ENST00000569439	CFAP53	Q96M91	514 aa		27.55	■■■□□ 2
RGL3-216	ENST00000569439	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
RGL3-216	ENST00000569439	RALBP1	Q15311	655 aa		27.54	■■■□□ 2
RGL3-216	ENST00000569439	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		27.53	■■■□□ 2
RGL3-216	ENST00000569439	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2

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