RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 GMPRP36959 345 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-AS1-202ENST00000559357 MEIOBQ8N635 442 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-AS1-202ENST00000559357 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-AS1-202ENST00000559357 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
USP3-AS1-202ENST00000559357 IRF7Q92985 503 aa9.98□□□□□ -0.81
USP3-AS1-202ENST00000559357 BCANQ96GW7 911 aa9.98□□□□□ -0.81
USP3-AS1-202ENST00000559357 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.98□□□□□ -0.81
USP3-AS1-202ENST00000559357 C6orf118Q5T5N4 469 aa9.97□□□□□ -0.81
USP3-AS1-202ENST00000559357 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.97□□□□□ -0.81
USP3-AS1-202ENST00000559357 ERBB4Q15303 1308 aa9.97□□□□□ -0.81
USP3-AS1-202ENST00000559357 NR6A1Q15406 480 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 OCSTAMPQ9BR26 566 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 BMP2P12643 396 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAN1A2O60476 641 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 AP1G2O75843 785 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 UPP2O95045 317 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 VSIG8P0DPA2 414 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 UNC13AQ9UPW8 1703 aa9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 DNMT3LQ9UJW3 386 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-202ENST00000559357 Q6ZVU0 165 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZBTB33Q86T24 672 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 USP17L8P0C7I0 530 aa9.88□□□□□ -0.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 PTK2Q05397 1052 aa9.88□□□□□ -0.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.88□□□□□ -0.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 CBLBQ13191 982 aa9.87□□□□□ -0.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPFIA3O75145 1194 aa9.86□□□□□ -0.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 RFC5P40937 340 aa9.86□□□□□ -0.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADAM32Q8TC27 787 aa9.86□□□□□ -0.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 GOPCQ9HD26 462 aa9.85□□□□□ -0.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 TTLL8A6PVC2 850 aa9.84□□□□□ -0.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPINT1O43278 529 aa9.84□□□□□ -0.83
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP9.83□□□□□ -0.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 PNMA1Q8ND90 353 aa9.82□□□□□ -0.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC24A1O60721 1099 aa9.81□□□□□ -0.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.81□□□□□ -0.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRIM34Q9BYJ4 488 aa9.81□□□□□ -0.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 AGBL1Q96MI9 1066 aa9.8□□□□□ -0.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 PTSQ03393 145 aa9.79□□□□□ -0.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 FIGNL2A6NMB9 653 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 ESPNB1AK53 854 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-202ENST00000559357 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.77□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 ERVH48-1M5A8F1 160 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 LILRA1O75019 489 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 RELBQ01201 579 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 NEUROD2Q15784 382 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 RAB15P59190 212 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC35F4A4IF30 521 aa9.74□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADH1AP07327 375 aa9.74□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.74□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 BICRAQ9NZM4 1560 aa9.73□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 KRT76Q01546 638 aa9.73□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 IL27Q8NEV9 243 aa9.73□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 RNF217Q8TC41 542 aa9.73□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 SEPT12Q8IYM1 358 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZBBXA8MT70 800 aa9.71□□□□□ -0.86
USP3-AS1-202ENST00000559357 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
USP3-AS1-202ENST00000559357 FBXO45P0C2W1 286 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-202ENST00000559357 PTGIRP43119 386 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-202ENST00000559357 GSK3AP49840 483 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-202ENST00000559357 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-202ENST00000559357 KCNMA1Q12791 1236 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-202ENST00000559357 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-202ENST00000559357 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-202ENST00000559357 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-202ENST00000559357 ITGA6P23229 1130 aa9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-202ENST00000559357 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-202ENST00000559357 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-202ENST00000559357 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-202ENST00000559357 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.1 ms