RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519070.5

FAM49B-211, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM49B, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49B-211ENST00000519070 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.34■■□□□ 1.17
FAM49B-211ENST00000519070 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.34■■□□□ 1.17
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FAM49B-211ENST00000519070 CCDC7Q96M83 1385 aa22.34■■□□□ 1.17
FAM49B-211ENST00000519070 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
FAM49B-211ENST00000519070 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.33■■□□□ 1.16
FAM49B-211ENST00000519070 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.32■■□□□ 1.16
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FAM49B-211ENST00000519070 STRN4Q9NRL3 753 aa22.32■■□□□ 1.16
FAM49B-211ENST00000519070 EP400Q96L91 3159 aa22.3■■□□□ 1.16
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FAM49B-211ENST00000519070 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.29■■□□□ 1.16
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FAM49B-211ENST00000519070 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.28■■□□□ 1.16
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FAM49B-211ENST00000519070 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.27■■□□□ 1.16
FAM49B-211ENST00000519070 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.27■■□□□ 1.16
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FAM49B-211ENST00000519070 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.26■■□□□ 1.15
FAM49B-211ENST00000519070 BARGINQ6ZT62 677 aa22.25■■□□□ 1.15
FAM49B-211ENST00000519070 IP6K1Q92551 441 aa22.25■■□□□ 1.15
FAM49B-211ENST00000519070 ERBB3P21860 1342 aa22.24■■□□□ 1.15
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FAM49B-211ENST00000519070 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
FAM49B-211ENST00000519070 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
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FAM49B-211ENST00000519070 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.22■■□□□ 1.15
FAM49B-211ENST00000519070 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
FAM49B-211ENST00000519070 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.21■■□□□ 1.15
FAM49B-211ENST00000519070 DISP2A7MBM2 1401 aa22.21■■□□□ 1.15
FAM49B-211ENST00000519070 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.2■■□□□ 1.14
FAM49B-211ENST00000519070 USP35Q9P2H5 1018 aa22.2■■□□□ 1.14
FAM49B-211ENST00000519070 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
FAM49B-211ENST00000519070 RTL1A6NKG5 1358 aa22.19■■□□□ 1.14
FAM49B-211ENST00000519070 NSD2O96028 1365 aa22.19■■□□□ 1.14
FAM49B-211ENST00000519070 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
FAM49B-211ENST00000519070 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
FAM49B-211ENST00000519070 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM49B-211ENST00000519070 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM49B-211ENST00000519070 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM49B-211ENST00000519070 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM49B-211ENST00000519070 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM49B-211ENST00000519070 POLKQ9UBT6 870 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM49B-211ENST00000519070 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
FAM49B-211ENST00000519070 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM49B-211ENST00000519070 LRRC37A3O60309 1634 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM49B-211ENST00000519070 INSRP06213 1382 aa22.14■■□□□ 1.14
FAM49B-211ENST00000519070 AMPHP49418 695 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM49B-211ENST00000519070 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM49B-211ENST00000519070 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM49B-211ENST00000519070 FLT4P35916 1363 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM49B-211ENST00000519070 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
FAM49B-211ENST00000519070 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM49B-211ENST00000519070 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM49B-211ENST00000519070 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
FAM49B-211ENST00000519070 FAM182BQ5T319 152 aa22.1■■□□□ 1.13
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FAM49B-211ENST00000519070 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.09■■□□□ 1.13
FAM49B-211ENST00000519070 NCAPD2Q15021 1401 aa22.08■■□□□ 1.13
FAM49B-211ENST00000519070 A0A0G2JS52 829 aa22.08■■□□□ 1.13
FAM49B-211ENST00000519070 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
FAM49B-211ENST00000519070 MYT1Q01538 1121 aa22.08■■□□□ 1.13
FAM49B-211ENST00000519070 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.08■■□□□ 1.13
FAM49B-211ENST00000519070 NBPF4Q96M43 638 aa22.08■■□□□ 1.13
FAM49B-211ENST00000519070 MORC1Q86VD1 984 aa22.07■■□□□ 1.12
FAM49B-211ENST00000519070 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
FAM49B-211ENST00000519070 TNS2Q63HR2 1409 aa22.04■■□□□ 1.12
FAM49B-211ENST00000519070 MEGF6O75095 1541 aa22.03■■□□□ 1.12
FAM49B-211ENST00000519070 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
FAM49B-211ENST00000519070 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
FAM49B-211ENST00000519070 IL2RBP14784 551 aa22.02■■□□□ 1.12
FAM49B-211ENST00000519070 DDB1Q16531 1140 aa22.02■■□□□ 1.12
FAM49B-211ENST00000519070 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.02■■□□□ 1.12
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FAM49B-211ENST00000519070 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
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FAM49B-211ENST00000519070 SBF2Q86WG5 1849 aa22■■□□□ 1.11
FAM49B-211ENST00000519070 CCDC125Q86Z20 511 aa21.99■■□□□ 1.11
FAM49B-211ENST00000519070 EYA1Q99502 592 aa21.99■■□□□ 1.11
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FAM49B-211ENST00000519070 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.97■■□□□ 1.11
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FAM49B-211ENST00000519070 MTHFSP49914 203 aa21.95■■□□□ 1.1
FAM49B-211ENST00000519070 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.95■■□□□ 1.1
FAM49B-211ENST00000519070 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
FAM49B-211ENST00000519070 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.94■■□□□ 1.1
FAM49B-211ENST00000519070 IL13P35225 146 aa21.93■■□□□ 1.1
FAM49B-211ENST00000519070 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.93■■□□□ 1.1
FAM49B-211ENST00000519070 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.92■■□□□ 1.1
FAM49B-211ENST00000519070 TRIM37O94972 964 aa21.92■■□□□ 1.1
FAM49B-211ENST00000519070 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
FAM49B-211ENST00000519070 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
FAM49B-211ENST00000519070 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.89■■□□□ 1.1
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