RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439407.1

LMCD1-AS1-202, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LMCD1-AS1, Length 576 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RIPK4P57078 832 aa8.84□□□□□ -0.99
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GOLGA2Q08379 1002 aa8.84□□□□□ -0.99
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TNS3Q68CZ2 1445 aa8.84□□□□□ -0.99
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KIF24Q5T7B8 1368 aa8.84□□□□□ -0.99
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 USP19O94966 1318 aa8.83□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.83□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TMPOP42166 694 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CERKQ8TCT0 537 aa8.83□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PLEKHF1Q96S99 279 aa8.83□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 EYA1Q99502 592 aa8.83□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.83□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CHRNA2Q15822 529 aa8.82□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.82□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CDCA7LQ96GN5 454 aa8.82□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RTL1A6NKG5 1358 aa8.82□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PXDNQ92626 1479 aa8.82□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SHPRHQ149N8 1683 aa8.81□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 EVA1CP58658 441 aa8.81□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NFE2L2Q16236 605 aa8.81□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.81□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 WWC1Q8IX03 1113 aa8.81□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PHACTR3Q96KR7 559 aa8.81□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PRDM11Q9NQV5 511 aa8.81□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NEFLP07196 543 aa8.8□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LMOD3Q0VAK6 560 aa8.8□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CCDC27Q2M243 656 aa8.8□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 WDR63Q8IWG1 891 aa8.8□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 USHBP1Q8N6Y0 703 aa8.8□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.8□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 USP54Q70EL1 1684 aa8.79□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 E9PSI1 815 aa8.79□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SLFN5Q08AF3 891 aa8.79□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.79□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NBPF4Q96M43 638 aa8.79□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.79□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PEAK1Q9H792 1746 aa8.79□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SLIT3O75094 1523 aa8.79□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ALS2Q96Q42 1657 aa8.78□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KIAA0232Q92628 1395 aa8.78□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GAS2L2Q8NHY3 880 aa8.78□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MYH16Q9H6N6 1097 aa8.78□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.78□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NFAT5O94916 1531 aa8.78□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa8.78□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 IGSF1Q8N6C5 1336 aa8.78□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LTN1O94822 1766 aa8.77□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa8.77□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 STRN4Q9NRL3 753 aa8.77□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TRIM35Q9UPQ4 493 aa8.77□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ZNF521Q96K83 1311 aa8.77□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FAM83GA6ND36 823 aa8.76□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TATP17735 454 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa8.76□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RCAN3Q9UKA8 241 aa8.76□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NHSL1Q5SYE7 1610 aa8.76□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CPDO75976 1380 aa8.75□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ADAMTS2O95450 1211 aa8.75□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 AMOTQ4VCS5 1084 aa8.75□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.75□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.75□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ERBB3P21860 1342 aa8.75□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GNAT3A8MTJ3 354 aa8.74□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GNAI1P63096 354 aa8.74□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DCTN1Q14203 1278 aa8.74□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 C1orf141Q5JVX7 400 aa8.74□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 BTG4Q9NY30 223 aa8.74□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 IL16Q14005 1332 aa8.74□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PHLPP1O60346 1717 aa8.74□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FKBP8Q14318 412 aa8.73□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MCM10Q7L590 875 aa8.73□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SPG7Q9UQ90 795 aa8.73□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KDRP35968 1356 aa8.73□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 IFT57Q9NWB7 429 aa8.72□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 USP35Q9P2H5 1018 aa8.72□□□□□ -1.01
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 WDR17Q8IZU2 1322 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9 ms