RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434221.5

TTC28-AS1-213, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 972 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-213ENST00000434221 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.66■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-213ENST00000434221 VPS72Q15906 364 aa22.66■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-213ENST00000434221 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-213ENST00000434221 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.66■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-213ENST00000434221 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-213ENST00000434221 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-213ENST00000434221 FBLN1P23142 703 aa22.63■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-213ENST00000434221 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.62■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-213ENST00000434221 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.62■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-213ENST00000434221 PEAK1Q9H792 1746 aa22.62■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-213ENST00000434221 EVA1CP58658 441 aa22.61■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-213ENST00000434221 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-213ENST00000434221 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.59■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-213ENST00000434221 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.59■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-213ENST00000434221 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.59■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-213ENST00000434221 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-213ENST00000434221 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.58■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-213ENST00000434221 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.58■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-213ENST00000434221 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.58■■□□□ 1.21
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TTC28-AS1-213ENST00000434221 CRB1P82279 1406 aa22.57■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-213ENST00000434221 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.57■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-213ENST00000434221 NSD2O96028 1365 aa22.56■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-213ENST00000434221 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-213ENST00000434221 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-213ENST00000434221 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.55■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-213ENST00000434221 RTL1A6NKG5 1358 aa22.53■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-213ENST00000434221 A0A0G2JS52 829 aa22.53■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-213ENST00000434221 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-213ENST00000434221 AMPHP49418 695 aa22.53■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-213ENST00000434221 MYT1Q01538 1121 aa22.53■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-213ENST00000434221 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-213ENST00000434221 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-213ENST00000434221 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-213ENST00000434221 HOXC9P31274 260 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-213ENST00000434221 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-213ENST00000434221 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-213ENST00000434221 IP6K1Q92551 441 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-213ENST00000434221 ERBB3P21860 1342 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-213ENST00000434221 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.5■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-213ENST00000434221 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.5■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-213ENST00000434221 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.5■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-213ENST00000434221 LRRC37A3O60309 1634 aa22.49■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-213ENST00000434221 MORC1Q86VD1 984 aa22.49■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-213ENST00000434221 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-213ENST00000434221 FLT4P35916 1363 aa22.49■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-213ENST00000434221 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-213ENST00000434221 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-213ENST00000434221 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.48■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-213ENST00000434221 SOCS7O14512 581 aa22.47■■□□□ 1.19
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TTC28-AS1-213ENST00000434221 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.46■■□□□ 1.19
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TTC28-AS1-213ENST00000434221 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.45■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-213ENST00000434221 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.45■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-213ENST00000434221 INSRP06213 1382 aa22.44■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-213ENST00000434221 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.44■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-213ENST00000434221 POLKQ9UBT6 870 aa22.44■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-213ENST00000434221 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-213ENST00000434221 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-213ENST00000434221 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.43■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-213ENST00000434221 EP400Q96L91 3159 aa22.42■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-213ENST00000434221 DISP2A7MBM2 1401 aa22.41■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-213ENST00000434221 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.4■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-213ENST00000434221 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-213ENST00000434221 FAM182BQ5T319 152 aa22.37■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-213ENST00000434221 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.36■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-213ENST00000434221 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.36■■□□□ 1.17
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TTC28-AS1-213ENST00000434221 NBPF4Q96M43 638 aa22.35■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-213ENST00000434221 SBF2Q86WG5 1849 aa22.34■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-213ENST00000434221 TNS2Q63HR2 1409 aa22.34■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-213ENST00000434221 MEGF6O75095 1541 aa22.33■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-213ENST00000434221 IL2RBP14784 551 aa22.33■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-213ENST00000434221 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-213ENST00000434221 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.33■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-213ENST00000434221 PDE3BQ13370 1112 aa22.32■■□□□ 1.16
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TTC28-AS1-213ENST00000434221 DDB1Q16531 1140 aa22.32■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-213ENST00000434221 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-213ENST00000434221 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-213ENST00000434221 MTHFSP49914 203 aa22.31■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-213ENST00000434221 NCAPD2Q15021 1401 aa22.3■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-213ENST00000434221 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.29■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-213ENST00000434221 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-213ENST00000434221 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.27■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-213ENST00000434221 EYA1Q99502 592 aa22.27■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-213ENST00000434221 EXOC5O00471 708 aa22.26■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-213ENST00000434221 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-213ENST00000434221 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.26■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-213ENST00000434221 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.25■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-213ENST00000434221 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.25■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-213ENST00000434221 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-213ENST00000434221 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.24■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-213ENST00000434221 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.23■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-213ENST00000434221 PPP2R1AP30153 589 aa22.23■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-213ENST00000434221 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.23■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-213ENST00000434221 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
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