RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375150.6

PRRT1-202, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,726 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-202ENST00000375150 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.17■■□□□ 1.62
PRRT1-202ENST00000375150 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PRRT1-202ENST00000375150 IL13P35225 146 aa25.15■■□□□ 1.62
PRRT1-202ENST00000375150 IP6K1Q92551 441 aa25.15■■□□□ 1.62
PRRT1-202ENST00000375150 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.15■■□□□ 1.62
PRRT1-202ENST00000375150 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PRRT1-202ENST00000375150 CPDO75976 1380 aa25.14■■□□□ 1.61
PRRT1-202ENST00000375150 ABCC6O95255 1503 aa25.14■■□□□ 1.61
PRRT1-202ENST00000375150 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
PRRT1-202ENST00000375150 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PRRT1-202ENST00000375150 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.1■■□□□ 1.61
PRRT1-202ENST00000375150 KIAA0232Q92628 1395 aa25.09■■□□□ 1.61
PRRT1-202ENST00000375150 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PRRT1-202ENST00000375150 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.07■■□□□ 1.6
PRRT1-202ENST00000375150 COL18A1P39060 1754 aa25.07■■□□□ 1.6
PRRT1-202ENST00000375150 FCHSD2O94868 740 aa25.06■■□□□ 1.6
PRRT1-202ENST00000375150 RUNDC1Q96C34 613 aa25.06■■□□□ 1.6
PRRT1-202ENST00000375150 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.06■■□□□ 1.6
PRRT1-202ENST00000375150 RGPD5Q99666 1765 aa25.05■■□□□ 1.6
PRRT1-202ENST00000375150 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.04■■□□□ 1.6
PRRT1-202ENST00000375150 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PRRT1-202ENST00000375150 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.03■■□□□ 1.6
PRRT1-202ENST00000375150 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.02■■□□□ 1.6
PRRT1-202ENST00000375150 HMOX1P09601 288 aa25.02■■□□□ 1.6
PRRT1-202ENST00000375150 CHRNA2Q15822 529 aa25.02■■□□□ 1.6
PRRT1-202ENST00000375150 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.01■■□□□ 1.59
PRRT1-202ENST00000375150 NEFMP07197 916 aa25.01■■□□□ 1.59
PRRT1-202ENST00000375150 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
PRRT1-202ENST00000375150 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.01■■□□□ 1.59
PRRT1-202ENST00000375150 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.01■■□□□ 1.59
PRRT1-202ENST00000375150 JCADQ9P266 1359 aa25.01■■□□□ 1.59
PRRT1-202ENST00000375150 EYA1Q99502 592 aa25■■□□□ 1.59
PRRT1-202ENST00000375150 LMO7Q8WWI1 1683 aa25■■□□□ 1.59
PRRT1-202ENST00000375150 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PRRT1-202ENST00000375150 PRKAR2BP31323 418 aa25■■□□□ 1.59
PRRT1-202ENST00000375150 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25■■□□□ 1.59
PRRT1-202ENST00000375150 PLEKHF1Q96S99 279 aa25■■□□□ 1.59
PRRT1-202ENST00000375150 ERBB3P21860 1342 aa24.99■■□□□ 1.59
PRRT1-202ENST00000375150 APAF1O14727 1248 aa24.99■■□□□ 1.59
PRRT1-202ENST00000375150 NGEFQ8N5V2 710 aa24.99■■□□□ 1.59
PRRT1-202ENST00000375150 KDRP35968 1356 aa24.99■■□□□ 1.59
PRRT1-202ENST00000375150 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PRRT1-202ENST00000375150 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.97■■□□□ 1.59
PRRT1-202ENST00000375150 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.97■■□□□ 1.59
PRRT1-202ENST00000375150 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.96■■□□□ 1.59
PRRT1-202ENST00000375150 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.96■■□□□ 1.59
PRRT1-202ENST00000375150 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.96■■□□□ 1.59
PRRT1-202ENST00000375150 HSPA1LP34931 641 aa24.94■■□□□ 1.58
PRRT1-202ENST00000375150 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.94■■□□□ 1.58
PRRT1-202ENST00000375150 NBPF4Q96M43 638 aa24.94■■□□□ 1.58
PRRT1-202ENST00000375150 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PRRT1-202ENST00000375150 FAM83GA6ND36 823 aa24.93■■□□□ 1.58
PRRT1-202ENST00000375150 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.93■■□□□ 1.58
PRRT1-202ENST00000375150 NCAPD2Q15021 1401 aa24.93■■□□□ 1.58
PRRT1-202ENST00000375150 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PRRT1-202ENST00000375150 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PRRT1-202ENST00000375150 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PRRT1-202ENST00000375150 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PRRT1-202ENST00000375150 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PRRT1-202ENST00000375150 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.9■■□□□ 1.58
PRRT1-202ENST00000375150 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.9■■□□□ 1.58
PRRT1-202ENST00000375150 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.89■■□□□ 1.58
PRRT1-202ENST00000375150 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.89■■□□□ 1.58
PRRT1-202ENST00000375150 ADAMTS2O95450 1211 aa24.89■■□□□ 1.57
PRRT1-202ENST00000375150 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
PRRT1-202ENST00000375150 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
PRRT1-202ENST00000375150 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.89■■□□□ 1.57
PRRT1-202ENST00000375150 NEUROD2Q15784 382 aa24.88■■□□□ 1.57
PRRT1-202ENST00000375150 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.88■■□□□ 1.57
PRRT1-202ENST00000375150 NFE2L2Q16236 605 aa24.87■■□□□ 1.57
PRRT1-202ENST00000375150 CCDC27Q2M243 656 aa24.86■■□□□ 1.57
PRRT1-202ENST00000375150 BTG4Q9NY30 223 aa24.86■■□□□ 1.57
PRRT1-202ENST00000375150 EVA1CP58658 441 aa24.86■■□□□ 1.57
PRRT1-202ENST00000375150 PDE3BQ13370 1112 aa24.86■■□□□ 1.57
PRRT1-202ENST00000375150 ZNF521Q96K83 1311 aa24.84■■□□□ 1.57
PRRT1-202ENST00000375150 RIPK4P57078 832 aa24.84■■□□□ 1.57
PRRT1-202ENST00000375150 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.83■■□□□ 1.57
PRRT1-202ENST00000375150 STRN4Q9NRL3 753 aa24.83■■□□□ 1.57
PRRT1-202ENST00000375150 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.83■■□□□ 1.57
PRRT1-202ENST00000375150 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.83■■□□□ 1.57
PRRT1-202ENST00000375150 WWC1Q8IX03 1113 aa24.83■■□□□ 1.57
PRRT1-202ENST00000375150 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PRRT1-202ENST00000375150 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.81■■□□□ 1.56
PRRT1-202ENST00000375150 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.81■■□□□ 1.56
PRRT1-202ENST00000375150 CRB1P82279 1406 aa24.81■■□□□ 1.56
PRRT1-202ENST00000375150 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.8■■□□□ 1.56
PRRT1-202ENST00000375150 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.8■■□□□ 1.56
PRRT1-202ENST00000375150 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.8■■□□□ 1.56
PRRT1-202ENST00000375150 NRAPQ86VF7 1730 aa24.8■■□□□ 1.56
PRRT1-202ENST00000375150 GOLGA2Q08379 1002 aa24.79■■□□□ 1.56
PRRT1-202ENST00000375150 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PRRT1-202ENST00000375150 LRP6O75581 1613 aa24.79■■□□□ 1.56
PRRT1-202ENST00000375150 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.78■■□□□ 1.56
PRRT1-202ENST00000375150 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PRRT1-202ENST00000375150 WDR63Q8IWG1 891 aa24.78■■□□□ 1.56
PRRT1-202ENST00000375150 SLIT2O94813 1529 aa24.77■■□□□ 1.56
PRRT1-202ENST00000375150 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.77■■□□□ 1.56
PRRT1-202ENST00000375150 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PRRT1-202ENST00000375150 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PRRT1-202ENST00000375150 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms