RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 NUP160Q12769 1436 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 HIP1O00291 1037 aa14.58□□□□□ -0.07
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PTPRS-201ENST00000262963 ZNF428Q96B54 188 aa14.58□□□□□ -0.08
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PTPRS-201ENST00000262963 RAD21O60216 631 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-201ENST00000262963 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-201ENST00000262963 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-201ENST00000262963 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
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PTPRS-201ENST00000262963 RABEP1Q15276 862 aa14.57□□□□□ -0.08
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PTPRS-201ENST00000262963 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-201ENST00000262963 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRS-201ENST00000262963 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
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PTPRS-201ENST00000262963 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-201ENST00000262963 PDCP20941 246 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-201ENST00000262963 MCM10Q7L590 875 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-201ENST00000262963 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-201ENST00000262963 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRS-201ENST00000262963 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-201ENST00000262963 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-201ENST00000262963 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRS-201ENST00000262963 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
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PTPRS-201ENST00000262963 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-201ENST00000262963 MBD3O95983 291 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-201ENST00000262963 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRS-201ENST00000262963 POGZQ7Z3K3 1410 aa14.53□□□□□ -0.08
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PTPRS-201ENST00000262963 FBXW7Q969H0 707 aa14.53□□□□□ -0.08
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PTPRS-201ENST00000262963 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.52□□□□□ -0.09
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PTPRS-201ENST00000262963 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.51□□□□□ -0.09
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PTPRS-201ENST00000262963 ZNF592Q92610 1267 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 GPS2Q13227 327 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 HOMER1Q86YM7 354 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 STRN4Q9NRL3 753 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 PBRM1Q86U86 1689 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 CABP4P57796 275 aa14.5□□□□□ -0.09
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PTPRS-201ENST00000262963 IFT57Q9NWB7 429 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 NSD2O96028 1365 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.49□□□□□ -0.09
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PTPRS-201ENST00000262963 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa14.48□□□□□ -0.09
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PTPRS-201ENST00000262963 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 FAM177BA6PVY3 158 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 PRDM11Q9NQV5 511 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 NASPP49321 788 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
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PTPRS-201ENST00000262963 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 FAM83GA6ND36 823 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 OLFM4Q6UX06 510 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRS-201ENST00000262963 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.11e-6■■■■□ 21
PTPRS-201ENST00000262963 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRS-201ENST00000262963 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRS-201ENST00000262963 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.45□□□□□ -0.1
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