RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 CFAP53Q96M91 514 aa24.88■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 SHPRHQ149N8 1683 aa24.88■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 ABCA3Q99758 1704 aa24.87■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 KIAA0232Q92628 1395 aa24.87■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 RGPD5Q99666 1765 aa24.86■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 ADAMTS2O95450 1211 aa24.83■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 IL13P35225 146 aa24.83■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 FLT4P35916 1363 aa24.83■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.82■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 IP6K1Q92551 441 aa24.82■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 FAM83GA6ND36 823 aa24.8■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 HMOX1P09601 288 aa24.8■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.8■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 INSRP06213 1382 aa24.79■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.78■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.78■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 COL18A1P39060 1754 aa24.78■■□□□ 1.56
PRRT1-201ENST00000211413 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.76■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.75■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 EYA1Q99502 592 aa24.75■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 NUDCQ9Y266 331 aa24.75■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 JCADQ9P266 1359 aa24.75■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 CPDO75976 1380 aa24.74■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 RTL1A6NKG5 1358 aa24.73■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.73■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.73■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 NBPF4Q96M43 638 aa24.73■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.72■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 STRN4Q9NRL3 753 aa24.71■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.71■■□□□ 1.55
PRRT1-201ENST00000211413 BTG4Q9NY30 223 aa24.7■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 LRP6O75581 1613 aa24.68■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 ERBB3P21860 1342 aa24.68■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.68■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.68■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.67■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.67■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 PRKAR2BP31323 418 aa24.67■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.67■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 APAF1O14727 1248 aa24.66■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 C8orf37Q96NL8 207 aa24.66■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.66■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.66■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 NEUROD2Q15784 382 aa24.65■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.65■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
PRRT1-201ENST00000211413 EVA1CP58658 441 aa24.63■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 USP35Q9P2H5 1018 aa24.63■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 FBXO41Q8TF61 875 aa24.63■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 FCHSD2O94868 740 aa24.61■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 RUNDC1Q96C34 613 aa24.61■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.61■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.6■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 FKBP8Q14318 412 aa24.6■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.6■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 NGLY1Q96IV0 654 aa24.6■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.6■■□□□ 1.53
PRRT1-201ENST00000211413 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.58■■□□□ 1.52
PRRT1-201ENST00000211413 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PRRT1-201ENST00000211413 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.55■■□□□ 1.52
PRRT1-201ENST00000211413 KDRP35968 1356 aa24.55■■□□□ 1.52
PRRT1-201ENST00000211413 ABCC6O95255 1503 aa24.55■■□□□ 1.52
PRRT1-201ENST00000211413 NEFLP07196 543 aa24.55■■□□□ 1.52
PRRT1-201ENST00000211413 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
PRRT1-201ENST00000211413 SLIT2O94813 1529 aa24.52■■□□□ 1.52
PRRT1-201ENST00000211413 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PRRT1-201ENST00000211413 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PRRT1-201ENST00000211413 NRAPQ86VF7 1730 aa24.51■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 RIPK4P57078 832 aa24.49■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.49■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 MEGF6O75095 1541 aa24.49■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 NCAPD2Q15021 1401 aa24.49■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.49■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.48■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 DCTN1Q14203 1278 aa24.48■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.48■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 USP21Q9UK80 565 aa24.48■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 CRB1P82279 1406 aa24.48■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 AFF2P51816 1311 aa24.47■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.47■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 NEFMP07197 916 aa24.47■■□□□ 1.51
PRRT1-201ENST00000211413 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
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