RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000092167.6

Ptprb-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprb, Length 11,911 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprb-201ENSMUST00000092167 CenphQ9QYM8 241 aa10.98□□□□□ -0.65
Ptprb-201ENSMUST00000092167 SrrtQ99MR6 875 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Speer4bQ9D9F7 267 aa10.97□□□□□ -0.65
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Lamb3Q61087 1168 aa10.97□□□□□ -0.65
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Slc13a4Q8BZ82 625 aa10.97□□□□□ -0.65
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Pof1bQ8K4L4 587 aa10.97□□□□□ -0.65
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ehmt1Q5DW34 1296 aa10.97□□□□□ -0.65
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa10.97□□□□□ -0.65
Ptprb-201ENSMUST00000092167 L3mbtl2P59178 703 aa10.96□□□□□ -0.65
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Gnl2Q99LH1 728 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ccdc102aQ3TMW1 549 aa10.96□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa10.96□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Washc2Q6PGL7 1334 aa10.95□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 MvpQ9EQK5 861 aa10.95□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa10.95□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ssr1Q9CY50 286 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Brf1Q8CFK2 676 aa10.95□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Pms1Q8K119 917 aa10.95□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 PrxO55103 1391 aa10.95□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ift57Q8BXG3 429 aa10.95□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Pdia4P08003 638 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Trim25Q61510 634 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Phf14Q9D4H9 881 aa10.95□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Krt85Q9Z2T6 507 aa10.95□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Btbd11Q6GQW0 1109 aa10.95□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Kiaa0753Q6A000 959 aa10.95□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Stard3nlQ9DCI3 235 aa10.94□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Cdca7Q9D0M2 382 aa10.94□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Fsd2Q8BZ52 692 aa10.94□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa10.94□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Gm7361D3Z6R1 267 aa10.94□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa10.94□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Gm1979E9QAN3 267 aa10.94□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Gm5862K7N5V5 267 aa10.94□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Gm10220K7N660 267 aa10.94□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Chaf1aQ9QWF0 911 aa10.94□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Eif5P59325 429 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Slu7Q8BHJ9 585 aa10.93□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa10.93□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Efcab5A0JP43 1406 aa10.93□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Fam13aQ8BGI4 693 aa10.93□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Prdm16A2A935 1275 aa10.93□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ccdc181Q80ZU5 509 aa10.93□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Grin2bQ01097 1482 aa10.93□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Aplp1Q03157 653 aa10.93□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Dctn1O08788 1281 aa10.93□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Fam50bQ9WTJ8 334 aa10.92□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Prl7d1P04769 244 aa10.92□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Fez1Q8K0X8 392 aa10.92□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Kif3cO35066 796 aa10.92□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Golim4Q8BXA1 655 aa10.92□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Afap1Q80YS6 731 aa10.92□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Med4Q9CQA5 270 aa10.92□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa10.92□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Dhx8A2A4P0 1244 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Iqca1Q9CUL5 857 aa10.92□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Irgm2A0A140LIF8 407 aa10.91□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Mapk8ip1Q9WVI9 707 aa10.91□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 NrkQ9R0G8 1455 aa10.91□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Mcm3P25206 812 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ripply1Q2WG77 201 aa10.91□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 PsapQ61207 557 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ppfia3P60469 1194 aa10.91□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Top1mtQ8R4U6 593 aa10.91□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Asxl1P59598 1514 aa10.91□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Tango6Q8C3S2 1079 aa10.91□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 MycnP03966 462 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Stim1P70302 685 aa10.91□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Top2bQ64511 1612 aa10.91□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa10.9□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 PtprkP35822 1457 aa10.9□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Cep57l1Q8VDS7 400 aa10.9□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Def6Q8C2K1 630 aa10.9□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Rufy2Q8R4C2 606 aa10.9□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa10.9□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Bicdl1A0JNT9 577 aa10.9□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Cfap58B2RW38 873 aa10.9□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Hap1O35668 628 aa10.9□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 OptnQ8K3K8 584 aa10.9□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Nup133Q8R0G9 1155 aa10.9□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Trim34bJ3QNR8 485 aa10.9□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Strn4P58404 760 aa10.9□□□□□ -0.66
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Slx4Q6P1D7 1565 aa10.9□□□□□ -0.67
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Sall3Q62255 1320 aa10.9□□□□□ -0.67
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Rnf187Q8BFX1 236 aa10.9□□□□□ -0.67
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Cbx1P83917 185 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Lrrcc1Q69ZB0 1026 aa10.89□□□□□ -0.67
Ptprb-201ENSMUST00000092167 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Cdc45Q9Z1X9 566 aa10.89□□□□□ -0.67
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Plekhg5Q66T02 1073 aa10.89□□□□□ -0.67
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Map3k1P53349 1493 aa10.89□□□□□ -0.67
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Fkbp5Q64378 456 aa10.89□□□□□ -0.67
Ptprb-201ENSMUST00000092167 VeztQ3ZK22 780 aa10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.7 ms