RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592561.5

PSMD8-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 8, human

TSL 2

Gene PSMD8, Length 771 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD8-208	ENST00000592561	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	ART4	Q93070	314 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	PGM2	Q96G03	612 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	HHIP	Q96QV1	700 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	FAM129B	Q96TA1	746 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	VAT1	Q99536	393 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	MGME1	Q9BQP7	344 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	EPN3	Q9H201	632 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	11.09	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	BNIP3L	O60238	219 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	NEBL	O76041	1014 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	JCHAIN	P01591	159 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	HLA-DQB2	P05538	268 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	GABRG2	P18507	467 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	CR2	P20023	1033 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	PTPN3	P26045	913 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	RBL1	P28749	1068 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	MAPK8	P45983	427 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	RGR	P47804	291 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	PMS2	P54278	862 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	GNGT1	P63211	74 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	ZBTB16	Q05516	673 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	RAD51	Q06609	339 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	ZNF844	Q08AG5	666 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	WASHC5	Q12768	1159 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	CALCOCO2	Q13137	446 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	TRADD	Q15628	312 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	MYLK3	Q32MK0	819 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	TEX44	Q53QW1	395 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	PGBD5	Q8N414	524 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	CNTD1	Q8N815	330 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	CHST14	Q8NCH0	376 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	TMIE	Q8NEW7	156 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	HMGB4	Q8WW32	186 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	EXOC2	Q96KP1	924 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	KCNK17	Q96T54	332 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	HINFP	Q9BQA5	517 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	USP29	Q9HBJ7	922 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	NT5M	Q9NPB1	228 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	EBF1	Q9UH73	591 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	IL36A	Q9UHA7	158 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	CFAP69	A5D8W1	941 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	RNF103	O00237	685 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	KCNN4	O15554	427 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	ADH1B	P00325	375 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	KRT14	P02533	472 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	PRNP	P04156	253 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	ITGAV	P06756	1048 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	CTSL	P07711	333 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	TDGF1	P13385	188 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	NDUFV2	P19404	249 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	CES1	P23141	567 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	SCNN1B	P51168	640 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	EMP3	P54852	163 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	MAX	P61244	160 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	AP1S1	P61966	158 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	GRM3	Q14832	879 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	CST6	Q15828	149 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PSMD8-208	ENST00000592561	DENND2C	Q68D51	928 aa		11.07	□□□□□ -0.64

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