RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484581.6

VPS13A-211, Transcript of vacuolar protein sorting 13 homolog A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A, Length 1,155 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-211ENST00000484581 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 FBXO4Q9UKT5 387 aa4.71□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 TNFSF13BQ9Y275 285 aa4.71□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa4.71□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 CLGNO14967 610 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 HCRTR2O43614 444 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 HS6ST1O60243 411 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 GCATO75600 419 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 IL1AP01583 271 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 TFP02787 698 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 TUBBP07437 444 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 CYP2D6P10635 497 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 OAS2P29728 719 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 MSH2P43246 934 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 CAPZA2P47755 286 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 CYP2J2P51589 502 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 TFCP2Q12800 502 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 PPP2R5BQ15173 497 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 C9orf152Q5JTZ5 239 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 TBC1D9BQ66K14 1250 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 KRT80Q6KB66 452 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 TRIM72Q6ZMU5 477 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 KBTBD6Q86V97 674 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 ARHGEF25Q86VW2 580 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 WDR5BQ86VZ2 330 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 SNX32Q86XE0 403 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 UEVLDQ8IX04 471 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 THNSL1Q8IYQ7 743 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 TMEM217Q8N7C4 229 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 FAM47BQ8NA70 645 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 GSDMBQ8TAX9 411 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 DUSP19Q8WTR2 217 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 HDAC7Q8WUI4 952 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 CCDC17Q96LX7 622 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 MACROD1Q9BQ69 325 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 PDZD7Q9H5P4 517 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 KIF9Q9HAQ2 790 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 DECR2Q9NUI1 292 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 C5AR2Q9P296 337 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 LRIT1Q9P2V4 623 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 PADI1Q9ULC6 663 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 MAFFQ9ULX9 164 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 SALL3Q9BXA9 1300 aa4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 A0A0A0MQY5 61 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 A0A1W2PPE2 198 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 A0A1W2PR64 198 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 PI4K2BG5E9Z4 385 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 IFNL4K9M1U5 179 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 EBAG9O00559 213 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 SLC25A12O75746 678 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 GGPS1O95749 300 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 MYBL1P10243 752 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 TMEM11P17152 192 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 EDN2P20800 178 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 THPOP40225 353 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 RARRES1P49788 294 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 CAMPP49913 170 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 LIG4P49917 911 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 STAT2P52630 851 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 KRTAP10-11P60412 298 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 RBP5P82980 135 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 SHBQ15464 509 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 PCGF3Q3KNV8 242 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 SLC10A5Q5PT55 438 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 NUGGCQ68CJ6 796 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 CEP85Q6P2H3 762 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 FAM47EQ6ZV65 393 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 CCDC186Q7Z3E2 898 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 IP6K1Q92551 441 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 BBS4Q96RK4 519 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 ABCF3Q9NUQ8 709 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 SEL1LQ9UBV2 794 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 NENFQ9UMX5 172 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 CARD8Q9Y2G2 431 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 TRPV2Q9Y5S1 764 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 MST1RQ04912 1400 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 UTYO14607 1347 aa4.69□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 LOC100509620A0A075B734 347 aa4.68□□□□□ -1.66
VPS13A-211ENST00000484581 RRHO14718 337 aa4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.3 ms