RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	CKMT2	P17540	419 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	ERCC2	P18074	760 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	NFKB1	P19838	968 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	LMO2	P25791	158 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	CASP2	P42575	452 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	MAGEA6	P43360	314 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	CSHL1	Q14406	222 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	SPCS2	Q15005	226 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	OXA1L	Q15070	435 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	RPS6KA2	Q15349	733 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	ANO4	Q32M45	955 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSUH2-208	ENST00000455157	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		11.46	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	NEMP2	A6NFY4	417 aa		11.46	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		11.46	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF839	A8K0R7	811 aa		11.46	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	DFFA	O00273	331 aa		11.46	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CLDN5	O00501	218 aa		11.46	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	RGS13	O14921	159 aa		11.46	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ALDH1A2	O94788	518 aa		11.46	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	STX1B	P61266	288 aa		11.46	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	NAB1	Q13506	487 aa		11.46	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	PIGZ	Q86VD9	579 aa		11.46	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	LILRA2	Q8N149	483 aa		11.46	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		11.46	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CYGB	Q8WWM9	190 aa		11.46	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		11.46	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157		G3V2L1	256 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	DPYSL4	O14531	572 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TIPRL	O75663	272 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	H6PD	O95479	791 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CD247	P20963	164 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	NMBR	P28336	390 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	GABRB3	P28472	473 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	NUMB	P49757	651 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	MAPK10	P53779	464 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	STEAP4	Q687X5	459 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	DLK2	Q6UY11	383 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	GPR141	Q7Z602	305 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM47B	Q8NA70	645 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	DLG3	Q92796	817 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	FAR2	Q96K12	515 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	OXSM	Q9NWU1	459 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	SATB2	Q9UPW6	733 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157		V9GYQ6	96 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TRIP11	Q15643	1979 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF195	O14628	629 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	HUS1	O60921	280 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	BMP10	O95393	424 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	APOA4	P06727	396 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	STMN1	P16949	149 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	PROZ	P22891	400 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	PTPN9	P43378	593 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	BAG6	P46379	1132 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	NDUFV1	P49821	464 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CTAG1A	P78358	180 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC15A4	Q8N697	577 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	TANK	Q92844	425 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	NXNL1	Q96CM4	212 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	POMK	Q9H5K3	350 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	DDIT4	Q9NX09	232 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CSAD	Q9Y600	493 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	CENPF	P49454	3210 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SSUH2-208	ENST00000455157	HEATR9	A2RTY3	570 aa		11.45	□□□□□ -0.58

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